Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11078
• Subject: NM_001105244.1
• Aligned Length: 1465
• Identities: 1386
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------MPSGSFMLVNAS  12
                                                                          ||||||||||||
Sbjct    1  MRGLGTCLATLAGLLLTAAGETFSGGCLFDEPYSTCGYSQSEGDDFNWEQVNTLTKPTSDPWMPSGSFMLVNAS  74

Query   13  GRPEGQRAHLLLPQLKENDTHCIDFHYFVSSKSNSPPGLLNVYVKVNNGPLGNPIWNISGDPARTWNRAELAIS  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   75  GRPEGQRAHLLLPQLKENDTHCIDFHYFVSSKSNSPPGLLNVYVKVNNGPLGNPIWNISGDPTRTWNRAELAIS  148

Query   87  TFWPNFYQVIFEVITSGHQGYLAIDEVKVLGHPCTRTPHFLRIQNVEVNAGQFATFQCSAIGRTVAGDRLWLQG  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TFWPNFYQVIFEVITSGHQGYLAIDEVKVLGHPCTRTPHFLRIQNVEVNAGQFATFQCSAIGRTVAGDRLWLQG  222

Query  161  IDVRDAPLKEIKVTSSRRFIASFNVVNTTKRDAGKYRCMIRTEGGVGISNYAELVVKEPPVPIAPPQLASVGAT  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  IDVRDAPLKEIKVTSSRRFIASFNVVNTTKRDAGKYRCMIRTEGGVGISNYAELVVKEPPVPIAPPQLASVGAT  296

Query  235  YLWIQLNANSINGDGPIVAREVEYCTASGSWNDRQPVDSTSYKIGHLDPDTEYEISVLLTRPGEGGTGSPGPAL  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  YLWIQLNANSINGDGPIVAREVEYCTASGSWNDRQPVDSTSYKIGHLDPDTEYEISVLLTRPGEGGTGSPGPAL  370

Query  309  RTRTKCADPMRGPRKLEVVEVKSRQITISWEPFGYNVTRCHSYNLTVHYCYQVGGQEQVREEVSWDTENSHPQH  382
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RTRTKCADPMRGPRKLEVVEVKSRQITIRWEPFGYNVTRCHSYNLTVHYCYQVGGQEQVREEVSWDTENSHPQH  444

Query  383  TITNLSPYTNVSVKLILMNPEGRKESQELIVQTDEDLPGAVPTESIQGSTFEEKIFLQWREPTQTYGVITLYEI  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TITNLSPYTNVSVKLILMNPEGRKESQELIVQTDEDLPGAVPTESIQGSTFEEKIFLQWREPTQTYGVITLYEI  518

Query  457  TYKAVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLFFGLYPGTTYSFTIRASTAKGFGPPATNQFTTKISAPSMPAYE  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TYKAVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLFFGLYPGTTYSFTIRASTAKGFGPPATNQFTTKISAPSMPAYE  592

Query  531  LETPLNQTDNTVTVMLKPAHSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEILKCYPVPIHFQNASLLNSQYYFAAEFP  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LETPLNQTDNTVTVMLKPAHSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEILKCYPVPIHFQNASLLNSQYYFAAEFP  666

Query  605  ADSLQAAQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPYKSYRIYFQAASRANGETKIDCVQVATKGAATPKPVPEPEKQTDHT  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ADSLQAAQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPYKSYRIYFQAASRANGETKIDCVQVATKGAATPKPVPEPEKQTDHT  740

Query  679  VKIAGVIAGILLFVIIFLGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGTNCDEAFSFMDTHNL  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  VKIAGVIAGILLFVIIFLGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGTNCDEAFSFMDTHNL  814

Query  753  NGRSVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYP-------------DETHTMASDTSSLVQSHTYKKREPADVPYQTGQ  813
            ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  NGRSVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYPDPFVPTAILVPINDETHTMASDTSSLVQSHTYKKREPADVPYQTGQ  888

Query  814  LHPAIRVADLLQHITQMKCAEGYGFKEEYESFFEGQSAPWDSAKKGENRMKNRYGNIIAYDHSRVRLQTIEGDT  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LHPAIRVADLLQHITQMKCAEGYGFKEEYESFFEGQSAPWDSAKKDENRMKNRYGNIIAYDHSRVRLQTIEGDT  962

Query  888  NSDYINGNYIDGYHRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNLVEVGRVKCCKYWPDDTEIYKDIK  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NSDYINGNYIDGYHRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNLVEVGRVKCCKYWPDDTEIYKDIK  1036

Query  962  VTLIETELLAEYVIRTFAVEKRGVHEIREIRQFHFTGWPDRGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPSAGPLVVHCSA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  VTLIETELLAEYVIRTFAVEKRGVHEIREIRQFHFTGWPDHGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPSAGPLVVHCSA  1110

Query 1036  GAGRTGCFIVIDIMLDMAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSVPASQVRSLY  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGRTGCFIVIDIMLDMAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSVPASQVRSLY  1184

Query 1110  YDMNKLDPQTNSSQIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSNYINA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  YDMNKLDPQTNSSQIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSNYINA  1258

Query 1184  ALMDSYKQPSAFIVTQHPLPNTVKDFWRLVLDYHCTSVVMLNDVDPAQLCPQYWPENGVHRHGPIQVEFVSADL  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ALMDSYKQPSAFIVTQHPLPNTVKDFWRLVLDYHCTSVVMLNDVDPAQLCPQYWPENGVHRHGPIQVEFVSADL  1332

Query 1258  EEDIISRIFRIYNAARPQDGYRMVQQFQFLGWPMYRDTPVSKRSFLKLIRQVDKWQEEYNGGEGRTVVHCLNGG  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  EEDIISRIFRIYNAARPQDGYRMVQQFQFLGWPMYRDTPVSKRSFLKLIRQVDKWQEEYNGGEGRTVVHCLNGG  1406

Query 1332  GRSGTFCAISIVCEMLRHQRTVDVFHAVKTLRNNKPNMVDLLDQYKFCYEVALEYLNSG  1390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GRSGTFCAISIVCEMLRHQRTVDVFHAVKTLRNNKPNMVDLLDQYKFCYEVALEYLNSG  1465