Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11078
• Subject: NM_008984.2
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1355
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------MPSGSFMLVNAS  12
                                                                          ||||||||||.|
Sbjct    1  MRTLGTCLVTLAGLLLTAAGETFSGGCLFDEPYSTCGYSQADEDDFNWEQVNTLTKPTSDPWMPSGSFMLVNTS  74

Query   13  GRPEGQRAHLLLPQLKENDTHCIDFHYFVSSKSNSPPGLLNVYVKVNNGPLGNPIWNISGDPARTWNRAELAIS  86
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct   75  GKPEGQRAHLLLPQLKENDTHCIDFHYFVSSKSNAAPGLLNVYVKVNNGPLGNPIWNISGDPTRTWHRAELAIS  148

Query   87  TFWPNFYQVIFEVITSGHQGYLAIDEVKVLGHPCTRTPHFLRIQNVEVNAGQFATFQCSAIGRTVAGDRLWLQG  160
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TFWPNFYQVIFEVVTSGHQGYLAIDEVKVLGHPCTRTPHFLRIQNVEVNAGQFATFQCSAIGRTVAGDRLWLQG  222

Query  161  IDVRDAPLKEIKVTSSRRFIASFNVVNTTKRDAGKYRCMIRTEGGVGISNYAELVVKEPPVPIAPPQLASVGAT  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  IDVRDAPLKEIKVTSSRRFIASFNVVNTTKRDAGKYRCMICTEGGVGISNYAELVVKEPPVPIAPPQLASVGAT  296

Query  235  YLWIQLNANSINGDGPIVAREVEYCTASGSWNDRQPVDSTSYKIGHLDPDTEYEISVLLTRPGEGGTGSPGPAL  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  YLWIQLNANSINGDGPIVAREVEYCTASGSWNDRQPVDSTSYKIGHLDPDTEYEISVLLTRPGEGGTGSPGPAL  370

Query  309  RTRTKCADPMRGPRKLEVVEVKSRQITISWEPFGYNVTRCHSYNLTVHYCYQVGGQEQVREEVSWDTENSHPQH  382
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  RTRTKCADPMRGPRKLEVVEVKSRQITIRWEPFGYNVTRCHSYNLTVHYGYQVGGQEQVREEVSWDTDNSHPQH  444

Query  383  TITNLSPYTNVSVKLILMNPEGRKESQELIVQTDEDLPGAVPTESIQGSTFEEKIFLQWREPTQTYGVITLYEI  456
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TITNLSPYTNVSVKLILMNPEGRKESQELTVQTDEDLPGAVPTESIQGSAFEEKIFLQWREPTQTYGVITLYEI  518

Query  457  TYKAVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLFFGLYPGTTYSFTIRASTAKGFGPPATNQFTTKISAPSMPAYE  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TYKAVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLFFGLYPGTTYSFTIRASTAKGFGPPATNQFTTKISAPSMPAYE  592

Query  531  LETPLNQTDNTVTVMLKPAHSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEILKCYPVPIHFQNASLLNSQYYFAAEFP  604
            .||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  FETPLNQTDNTVTVMLKPAQSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEILKCYPVPIHFQNASILNSQYYFAAEFP  666

Query  605  ADSLQAAQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPYKSYRIYFQAASRANGETKIDCVQVATKGAATPKPVPEPEKQTDHT  678
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  667  ADSLQAAQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPHKSYRIYYQAASRANGETKIDCVRVATKGAVTPKPVPEPEKQTDHT  740

Query  679  VKIAGVIAGILLFVIIFLGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGTNCDEAFSFMDTHNL  752
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  VKIAGVIAGILLFVIIFLGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGTNCDEAFSFMGTHNL  814

Query  753  NGRSVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYPDETHTMASDTSSLVQSHTYKKREPADVPYQTGQLHPAIRVADLLQH  826
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  NGRSVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYPDETHTMASDTSSLAQPHTYKKREAADVPYQTGQLHPAIRVADLLQH  888

Query  827  ITQMKCAEGYGFKEEYESFFEGQSAPWDSAKKGENRMKNRYGNIIAYDHSRVRLQTIEGDTNSDYINGNYIDGY  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||
Sbjct  889  ITQMKCAEGYGFKEEYESFFEGQSAPWDSAKKDENRMKNRYGNIIAYDHSRVRLQMLEGDNNSDYINGNYIDGY  962

Query  901  HRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNLVEVGRVKCCKYWPDDTEIYKDIKVTLIETELLAEYV  974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  963  HRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNLVEVGRVKCCKYWPDDTEIYKDIKVTLIDTELLAEYV  1036

Query  975  IRTFAVEKRGVHEIREIRQFHFTGWPDRGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPSAGPLVVHCSAGAGRTGCFIVIDI  1048
            ||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  IRTFAVEKRGIHEIREIRQFHFTGWPDHGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPNAGPLVVHCSAGAGRTGCFIVIDI  1110

Query 1049  MLDMAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSVPASQVRSLYYDMNKLDPQTNSS  1122
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  MLDMAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSIPASQVRSLYYDMNKLDPQTNSS  1184

Query 1123  QIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDSYKQPSAFI  1196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  QIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDSYKQPSAFI  1258

Query 1197  VTQHPLPNTVKDFWRLVLDYHCTSVVMLNDVDPAQLCPQYWPENGVHRHGPIQVEFVSADLEEDIISRIFRIYN  1270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  VTQHPLPNTVKDFWRLVLDYHCTSVVMLNDVDPAQLCPQYWPENGVHRHGPIQVEFVSADLEEDIISRIFRIYN  1332

Query 1271  AARPQDGYRMVQQFQFLGWPMYRDTPVSKRSFLKLIRQVDKWQEEYNGGEGRTVVHCLNGGGRSGTFCAISIVC  1344
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ASRPQDGHRMVQQFQFLGWPMYRDTPVSKRSFLKLIRQVDKWQEEYNGGEGRTVVHCLNGGGRSGTFCAISIVC  1406

Query 1345  EMLRHQRTVDVFHAVKTLRNNKPNMVDLLDQYKFCYEVALEYLNSG  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  EMLRHQRTVDVFHAVKTLRNNKPNMVDLLDQYKFCYEVALEYLNSG  1452