Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11078
- Subject:
- XM_011525716.2
- Aligned Length:
- 4170
- Identities:
- 3706
- Gaps:
- 453
Alignment
Query 1 ATGCCATCAGGTTCTTTCATGCTGGTGAATGCCTCTGGGAGACCTGAGGGGCAGAGAGCCCACCTGCTCTTACC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCAACTTAAAGAAAATGACACCCACTGCATCGATTTTCACTATTTTGTGTCCAGCAAGAGTAATTCTCCTCCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGTTACTCAATGTCTACGTGAAGGTCAATAACGGGCCACTGGGGAATCCTATCTGGAATATATCTGGAGACCCA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCACGTACATGGAACAGGGCAGAACTGGCCATTAGTACTTTCTGGCCTAACTTTTATCAGGTGATTTTTGAAGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GATAACTTCTGGACATCAAGGCTATCTCGCTATCGATGAGGTGAAGGTGTTAGGACATCCATGTACCAGGACTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCACTTCCTGCGGATTCAGAATGTGGAAGTTAATGCTGGCCAGTTTGCTACCTTCCAGTGCAGTGCCATCGGC 444
|||.| ||..|| ||.||| |||||
Sbjct 1 ---------------------ATGGG------AACCCT----------CTCCCT------------CCATC--- 22
Query 445 AGGACCGTGGCAGGAGACAGGCTCTGGTTACAGGGCATTGATGTGCGAGATGCTCCTCTGAAGGAAATCAAGGT 518
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 ---------------------CT----------GGCATTGATGTGCGAGATGCTCCTCTGAAGGAAATCAAGGT 65
Query 519 GACCAGCTCCCGACGCTTCATTGCTTCATTTAATGTTGTGAATACCACCAAACGAGATGCTGGAAAGTACCGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 GACCAGCTCCCGACGCTTCATTGCTTCATTTAATGTTGTGAATACCACCAAACGAGATGCTGGAAAGTACCGCT 139
Query 593 GCATGATTCGCACTGAAGGAGGTGTTGGAATATCAAACTATGCAGAGTTGGTAGTTAAAGAACCACCCGTTCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 GCATGATTCGCACTGAAGGAGGTGTTGGAATATCAAACTATGCAGAGTTGGTAGTTAAAGAACCACCCGTTCCT 213
Query 667 ATTGCCCCACCTCAGCTCGCCTCTGTAGGAGCCACCTACCTGTGGATACAGCTCAACGCCAACTCCATCAATGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 ATTGCCCCACCTCAGCTCGCCTCTGTAGGAGCCACCTACCTGTGGATACAGCTCAACGCCAACTCCATCAATGG 287
Query 741 GGATGGGCCCATTGTGGCCCGAGAGGTGGAGTACTGCACGGCCAGTGGGAGCTGGAATGACCGGCAGCCAGTCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 GGATGGGCCCATTGTGGCCCGAGAGGTGGAGTACTGCACGGCCAGTGGGAGCTGGAATGACCGGCAGCCAGTCG 361
Query 815 ATTCCACGAGCTATAAAATTGGACACCTTGACCCAGATACAGAATATGAGATTAGTGTGCTCCTGACCAGGCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 ATTCCACGAGCTATAAAATTGGACACCTTGACCCAGATACAGAATATGAGATTAGTGTGCTCCTGACCAGGCCA 435
Query 889 GGGGAGGGTGGCACTGGCTCTCCTGGTCCGGCTCTCAGGACAAGAACAAAGTGTGCTGATCCCATGCGAGGCCC 962
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 GGGGAGGGTGGCACTGGCTCTCCTGGTCCAGCTCTCAGGACAAGAACAAAGTGTGCTGATCCCATGCGAGGCCC 509
Query 963 AAGAAAACTAGAAGTAGTGGAGGTCAAATCTCGGCAAATCACTATCAGCTGGGAGCCATTTGGATATAATGTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 AAGAAAACTAGAAGTAGTGGAGGTCAAATCTCGGCAAATCACTATCCGCTGGGAGCCATTTGGATATAATGTAA 583
Query 1037 CTCGTTGCCACAGTTATAATCTCACTGTCCACTACTGTTACCAAGTTGGAGGACAAGAACAAGTGCGAGAAGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CTCGTTGCCACAGTTATAATCTCACTGTCCACTACTGTTACCAAGTTGGAGGACAAGAACAAGTGCGAGAAGAA 657
Query 1111 GTAAGCTGGGATACAGAAAACTCACACCCTCAACACACGATCACTAACCTGTCACCATACACCAATGTCAGTGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GTAAGCTGGGATACAGAAAACTCACACCCTCAACACACGATCACTAACCTGTCACCATACACCAATGTCAGTGT 731
Query 1185 GAAACTGATCCTCATGAACCCAGAGGGCCGGAAGGAAAGCCAAGAACTCATAGTGCAGACAGATGAAGACCTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 GAAACTGATCCTCATGAACCCAGAGGGCCGGAAGGAAAGCCAAGAACTCATAGTGCAGACAGATGAAGACCTCC 805
Query 1259 CAGGTGCTGTTCCCACTGAATCCATACAAGGAAGTACCTTTGAAGAGAAGATATTTCTTCAGTGGAGAGAACCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 CAGGTGCTGTTCCCACTGAATCCATACAAGGAAGTACCTTTGAAGAGAAGATATTTCTTCAGTGGAGAGAACCA 879
Query 1333 ACTCAAACATATGGTGTAATCACTTTATATGAGATCACCTACAAAGCAGTCAGTTCCTTTGACCCAGAAATAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 ACTCAAACATATGGTGTAATCACTTTATATGAGATCACCTACAAAGCAGTCAGTTCCTTTGACCCAGAAATAGA 953
Query 1407 TTTATCCAATCAGAGTGGAAGAGTTTCAAAGCTGGGAAATGAAACCCATTTCCTGTTTTTTGGACTGTATCCGG 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TTTATCCAATCAGAGTGGAAGAGTTTCAAAGCTGGGAAATGAAACCCATTTTCTGTTTTTTGGACTGTATCCGG 1027
Query 1481 GGACCACATACTCCTTTACCATCCGAGCTAGCACAGCTAAGGGTTTTGGGCCTCCAGCAACAAACCAGTTCACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GGACCACATACTCCTTTACCATCCGAGCTAGCACAGCTAAGGGTTTTGGGCCTCCAGCAACAAACCAGTTCACC 1101
Query 1555 ACCAAAATATCAGCACCCTCTATGCCAGCTTATGAACTTGAGACACCTTTGAATCAAACTGACAATACCGTGAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 ACCAAAATATCAGCACCCTCTATGCCAGCTTATGAACTTGAGACACCTTTGAATCAAACTGACAATACCGTGAC 1175
Query 1629 AGTCATGCTGAAACCTGCCCACAGCAGAGGAGCACCTGTCAGTGTCTATCAAATAGTTGTTGAGGAAGAACGTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 AGTCATGCTGAAACCTGCCCACAGCAGAGGAGCACCTGTCAGTGTCTATCAAATAGTTGTTGAGGAAGAACGTC 1249
Query 1703 CTCGAAGAACTAAAAAGACGACAGAAATCTTAAAGTGCTACCCAGTGCCAATTCACTTCCAGAATGCTTCTCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CTCGAAGAACTAAAAAGACGACAGAAATCTTAAAGTGCTACCCAGTGCCAATTCACTTCCAGAATGCTTCTCTG 1323
Query 1777 CTGAACTCACAGTACTACTTTGCTGCAGAATTTCCTGCAGACAGCCTCCAAGCTGCGCAGCCTTTTACAATTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CTGAACTCACAGTACTACTTTGCTGCAGAATTTCCTGCAGACAGCCTCCAAGCTGCGCAGCCTTTTACAATTGG 1397
Query 1851 TGATAATAAGACATATAATGGATACTGGAACACTCCCCTTCTCCCCTATAAAAGCTACAGAATTTATTTCCAAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TGATAATAAGACATATAATGGATACTGGAACACTCCCCTTCTCCCCTATAAAAGCTACAGAATTTATTTCCAAG 1471
Query 1925 CTGCTAGTAGAGCCAATGGGGAAACCAAAATAGACTGTGTCCAAGTGGCCACAAAAGGAGCTGCCACTCCGAAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CTGCTAGTAGAGCCAATGGGGAAACCAAAATAGACTGTGTCCAAGTGGCCACAAAAGGAGCTGCCACTCCGAAA 1545
Query 1999 CCAGTCCCAGAACCCGAGAAACAGACAGACCATACAGTTAAAATTGCTGGAGTCATCGCGGGCATCTTGCTGTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CCAGTCCCAGAACCCGAGAAACAGACAGACCATACAGTTAAAATTGCTGGAGTCATCGCGGGCATCTTGCTGTT 1619
Query 2073 CGTGATTATATTTCTTGGAGTTGTGTTGGTAATGAAGAAAAGGAAACTGGCCAAGAAGCGGAAAGAGACCATGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CGTGATTATATTTCTTGGAGTTGTGTTGGTAATGAAGAAAAGGAAACTGGCCAAGAAGCGGAAAGAGACCATGA 1693
Query 2147 GCAGCACCCGACAGGAGATGACTGTGATGGTGAACTCAATGGACAAGAGCTATGCTGAGCAGGGCACAAACTGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 GCAGCACCCGACAGGAGATGACTGTGATGGTGAACTCAATGGACAAGAGCTATGCTGAGCAGGGCACAAACTGC 1767
Query 2221 GACGAGGCTTTCTCATTCATGGACACGCACAATCTGAATGGGAGATCTGTGTCTTCACCATCGTCCTTCACAAT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 GACGAGGCTTTCTCATTCATGGACACGCACAATCTGAATGGGAGATCTGTGTCTTCACCATCGTCCTTCACAAT 1841
Query 2295 GAAAACAAATACACTGAGCACATCGGTGCCTAATTCCTATTACCCAGATGAAACCCACACAATGGCCAGCGATA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 GAAAACAAATACACTGAGCACATCGGTGCCTAATTCCTATTACCCAGATGAAACCCACACAATGGCCAGCGATA 1915
Query 2369 CCAGCAGCCTGGTGCAGTCCCATACTTACAAGAAGCGAGAGCCGGCCGACGTGCCCTATCAGACTGGGCAGCTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 CCAGCAGCCTGGTGCAGTCCCATACTTACAAGAAGCGAGAGCCGGCCGACGTGCCCTATCAGACTGGGCAGCTC 1989
Query 2443 CACCCCGCCATCCGGGTGGCAGACCTCCTTCAGCACATCACACAGATGAAGTGTGCGGAGGGCTACGGCTTCAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 CACCCCGCCATCCGGGTGGCAGACCTCCTTCAGCACATCACACAGATGAAGTGTGCGGAGGGCTACGGCTTCAA 2063
Query 2517 GGAGGAATACGAGAGCTTCTTTGAAGGGCAGTCTGCACCATGGGACTCGGCTAAGAAAGGTGAGAACAGAATGA 2590
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2064 GGAGGAATACGAGAGCTTCTTTGAAGGGCAGTCTGCACCATGGGACTCGGCTAAGAAAGATGAGAACAGAATGA 2137
Query 2591 AGAACAGATACGGGAATATCATTGCATACGATCATTCCCGAGTGAGGCTGCAGACAATAGAAGGAGACACAAAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 AGAACAGATACGGGAATATCATTGCATACGATCATTCCCGAGTGAGGCTGCAGACAATAGAAGGAGACACAAAC 2211
Query 2665 TCAGACTATATCAATGGCAATTATATCGATGGTTATCATCGACCCAATCATTACATTGCTACCCAAGGGCCAAT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 TCAGACTATATCAATGGCAATTATATCGATGGTTATCATCGACCCAATCATTACATTGCTACCCAAGGGCCAAT 2285
Query 2739 GCAGGAAACCATCTATGACTTCTGGAGGATGGTGTGGCACGAAAACACTGCAAGTATCATCATGGTGACCAATC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 GCAGGAAACCATCTATGACTTCTGGAGGATGGTGTGGCACGAAAACACTGCAAGTATCATCATGGTGACCAATC 2359
Query 2813 TTGTGGAAGTGGGAAGGGTCAAATGCTGCAAATACTGGCCAGATGACACAGAGATATATAAAGACATTAAAGTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 TTGTGGAAGTGGGAAGGGTCAAATGCTGCAAATACTGGCCAGATGACACAGAGATATATAAAGACATTAAAGTT 2433
Query 2887 ACCCTAATAGAAACAGAACTACTGGCAGAATATGTGATAAGAACATTTGCTGTTGAAAAGAGAGGTGTGCATGA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 ACCCTAATAGAAACAGAACTACTGGCAGAATATGTGATAAGAACATTTGCTGTTGAAAAGAGAGGTGTGCATGA 2507
Query 2961 AATCCGAGAGATCAGACAGTTTCACTTCACTGGCTGGCCGGATCGTGGGGTCCCCTACCATGCCACCGGCCTGC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 AATCCGAGAGATCAGACAGTTTCACTTCACTGGCTGGCCGGATCATGGGGTCCCCTACCATGCCACCGGCCTGC 2581
Query 3035 TGGGATTCGTGCGGCAAGTCAAGTCCAAGAGCCCGCCCAGTGCAGGCCCACTGGTGGTGCACTGCAGTGCTGGT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2582 TGGGATTCGTGCGGCAAGTCAAGTCCAAGAGCCCGCCCAGTGCAGGCCCACTGGTGGTGCACTGCAGTGCTGGT 2655
Query 3109 GCAGGGAGGACTGGCTGTTTCATCGTCATTGATATCATGTTGGACATGGCCGAAAGGGAAGGGGTCGTAGACAT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2656 GCAGGGAGGACTGGCTGTTTCATCGTCATTGATATCATGTTGGACATGGCCGAAAGGGAAGGGGTCGTAGACAT 2729
Query 3183 CTACAACTGCGTCAGGGAGCTGCGGTCACGGAGGGTGAACATGGTGCAAACAGAGGAGCAGTATGTGTTTATCC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2730 CTACAACTGCGTCAGGGAGCTGCGGTCACGGAGGGTGAACATGGTGCAAACAGAGGAGCAGTATGTGTTTATCC 2803
Query 3257 ACGATGCGATCCTGGAAGCCTGTCTTTGTGGGGACACCTCTGTGCCTGCTTCCCAAGTTAGGTCTCTGTATTAT 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ACGATGCGATCCTGGAAGCCTGTCTTTGTGGGGACACCTCTGTGCCTGCTTCCCAAGTTAGGTCTCTGTATTAT 2877
Query 3331 GACATGAACAAACTGGATCCACAGACAAACTCAAGCCAGATTAAAGAGGAATTCCGGACGCTAAACATGGTGAC 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 GACATGAACAAACTGGATCCACAGACAAACTCAAGCCAGATTAAAGAGGAATTCCGGACGCTAAACATGGTGAC 2951
Query 3405 ACCAACGCTGCGAGTAGAGGACTGCAGCATCGCACTGTTGCCCCGGAACCATGAGAAAAACCGGTGCATGGACA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2952 ACCAACGCTGCGAGTAGAGGACTGCAGCATCGCACTGTTGCCCCGGAACCATGAGAAAAACCGGTGCATGGACA 3025
Query 3479 TCCTGCCCCCAGACCGCTGCCTGCCCTTCCTCATCACCATCGATGGGGAGAGCAGCAACTACATCAATGCTGCC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026 TCCTGCCCCCAGACCGCTGCCTGCCCTTCCTCATCACCATCGATGGGGAGAGCAGCAACTACATCAATGCTGCC 3099
Query 3553 CTCATGGACAGCTATAAACAGCCTTCAGCTTTTATAGTCACCCAGCATCCTTTGCCAAACACAGTGAAAGACTT 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3100 CTCATGGACAGCTATAAACAGCCTTCAGCTTTTATAGTCACCCAGCATCCTTTGCCAAACACAGTGAAAGACTT 3173
Query 3627 TTGGAGACTGGTCCTGGATTATCACTGCACATCCGTAGTTATGCTAAATGATGTGGATCCTGCCCAGTTGTGTC 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 TTGGAGACTGGTCCTGGATTATCACTGCACATCCGTAGTTATGCTAAATGATGTGGATCCTGCCCAGTTGTGTC 3247
Query 3701 CACAGTACTGGCCAGAAAACGGAGTACACAGACACGGCCCCATCCAGGTGGAATTTGTCTCTGCTGACCTGGAA 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 CACAGTACTGGCCAGAAAACGGAGTACACAGACACGGCCCCATCCAGGTGGAATTTGTCTCTGCTGACCTGGAA 3321
Query 3775 GAGGACATCATCAGCAGGATATTCCGCATTTACAATGCCGCCAGACCCCAAGATGGATATCGGATGGTGCAGCA 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3322 GAGGACATCATCAGCAGGATATTCCGCATTTACAATGCCGCCAGACCCCAAGATGGATATCGGATGGTGCAGCA 3395
Query 3849 ATTCCAGTTCCTGGGCTGGCCGATGTACAGGGACACACCAGTGTCTAAGCGCTCCTTCTTGAAGCTCATTCGCC 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3396 ATTCCAGTTCCTGGGCTGGCCGATGTACAGGGACACACCAGTGTCTAAGCGCTCCTTCTTGAAGCTCATTCGCC 3469
Query 3923 AGGTGGACAAGTGGCAAGAGGAATACAATGGCGGGGAAGGCCGCACCGTTGTGCACTGCTTGAACGGGGGAGGC 3996
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 AGGTGGACAAGTGGCAAGAGGAGTACAATGGCGGGGAAGGCCGCACGGTTGTGCACTGCTTGAACGGGGGAGGC 3543
Query 3997 CGCAGTGGGACGTTCTGCGCCATCAGCATCGTATGTGAGATGCTCCGGCACCAGAGAACCGTGGATGTCTTTCA 4070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3544 CGCAGTGGGACGTTCTGCGCCATCAGCATCGTATGTGAGATGCTCCGGCACCAGAGAACCGTGGATGTCTTTCA 3617
Query 4071 CGCTGTGAAGACACTGAGGAACAACAAGCCCAACATGGTCGACCTCCTGGATCAGTACAAGTTCTGCTACGAGG 4144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3618 CGCTGTGAAGACACTGAGGAACAACAAGCCCAACATGGTCGACCTCCTGGATCAGTACAAGTTCTGCTACGAGG 3691
Query 4145 TGGCCCTGGAATACTTGAATTCTGGC 4170
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3692 TGGCCCTGGAATACTTGAATTCTGGC 3717