Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11079
- Subject:
- NM_001199763.2
- Aligned Length:
- 2937
- Identities:
- 1686
- Gaps:
- 1251
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGCGCCCGCGGCGGCCTGGGGGTCTCGGGGGATCCGGGGGTCTCCGGCTGCTCCTCTGCCTCCTGCTGCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAGCAGCCGCCCGGGGGGCTGCAGCGCCGTTAGTGCCCACGGCTGTCTATTTGACCGCAGGCTCTGCTCTCACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGAAGTCTGTATTCAGGATGGCTTGTTTGGGCAGTGCCAGGTGGGAGTGGGGCAGGCCCGGCCCCTTTTGCAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTCACCTCCCCAGTTCTCCAACGCTTACAAGGTGTGCTCCGACAACTCATGTCCCAAGGATTGTCCTGGCACGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGACCTCACCCAGTATGTGATCTCTCAGGAGATGGAGCGCATCCCCAGGCTTCGCCCCCCAGAGCCCCGTCCAA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GGGACAGGTCTGGCTTGGCACCCAAGAGACCTGGTCCTGCTGGAGAGCTGCTTTTACAGGACATCCCCACTGGC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCCGCCCCTGCTGCCCAGCATCGGCTTCCACAACCACCAGTGGGCAAAGGTGGAGCTGGGGCCAGCTCCTCTCT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GTCCCCTCTGCAGGCTGAGCTGCTCCCGCCTCTCTTGGAGCACCTGCTGCTGCCCCCACAGCCTCCCCACCCTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CACTGAGTTACGAACCTGCCTTGCTGCAGCCCTACCTGTTCCACCAGTTTGGCTCCCGTGATGGCTCCAGGGTC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 TCAGAGGGCTCCCCAGGGATGGTCAGTGTCGGCCCCCTGCCCAAGGCTGAAGCCCCTGCCCTCTTCAGCAGAAC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TGCCTCCAAGGGCATATTTGGGGACCACCCTGGCCACTCCTACGGGGACCTTCCAGGGCCTTCACCTGCCCAGC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TTTTTCAAGACTCTGGGCTGCTCTATCTGGCCCAGGAGTTGCCAGCACCCAGCAGGGCCAGGGTGCCAAGGCTG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CCAGAGCAAGGGAGCAGCAGCCGGGCAGAGGACTCCCCAGAGGGCTATGAGAAGGAAGGACTAGGGGATCGTGG 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 AGAGAAGCCTGCTTCCCCAGCTGTGCAGCCAGATGCGGCTCTGCAGAGGCTGGCCGCTGTGCTGGCGGGCTATG 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 GGGTAGAGCTGCGTCAGCTGACCCCTGAGCAGCTCTCCACACTCCTGACCCTGCTGCAGCTACTGCCCAAGGGT 1110
Query 1 ------------------------------------------------------ATGGAGGGGCCGGTGGAGGG 20
||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGGAAGAAATCCGGGAGGGGTTGTAAATGTTGGAGCTGATATCAAGAAAACAATGGAGGGGCCGGTGGAGGG 1184
Query 21 CAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACACCCCACTGCCAGCCCTACCTCCAGTG 94
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACACCCCACTGCCAGCCCTACCTCCAGTG 1258
Query 95 AAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTGCCAGACCCCCTGTGACACCTGTCCTG 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTGCCAGACCCCCTGTGACACCTGTCCTG 1332
Query 169 CTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGACAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGCAGA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGACAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGCAGA 1406
Query 243 GGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGGCTGCAGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCCTGG 316
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAA-------------------------------------------- 1436
Query 317 CTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGTGTGGTGGGACCAGCCCTCACCTTCCGCATC 390
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 -------------------------------------------TGTGGTGGGACCAGCCCTCACCTTCCGCATC 1467
Query 391 CGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCAGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGC 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 CGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCAGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGC 1541
Query 465 ACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGAGGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAACTG 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 ACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGAGGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAACTG 1615
Query 539 CGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCCTGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTGGTG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 CGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCCTGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTGGTG 1689
Query 613 GCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGACAAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGGGCC 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 GCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGACAAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGGGCC 1763
Query 687 TGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCGCCAGCACATGGCCACGAAGTCCTTGT 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 TGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCGCCAGCACATGGCCACGAAGTCCTTGT 1837
Query 761 TCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCCCAG 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 TCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCCCAG 1911
Query 835 GCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCGGCCCAAGCCAACATGGACATCTCCAC 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 GCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCGGCCCAAGCCAACATGGACATCTCCAC 1985
Query 909 GGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGACCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGGCCC 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 GGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGACCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGGCCC 2059
Query 983 TCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGGAGGGCAACATCAAAAAGAACCGGCAT 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 TCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGGAGGGCAACATCAAAAAGAACCGGCAT 2133
Query 1057 CCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTACAT 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134 CCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTACAT 2207
Query 1131 CAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACATAGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCCATA 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 CAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACATAGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCCATA 2281
Query 1205 CCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCATCGTCATGCTGACCCCGCTGGTGGAG 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 CCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCATCGTCATGCTGACCCCGCTGGTGGAG 2355
Query 1279 GATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCCCTCTACCACGTATATGAGGTGAACCT 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356 GATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCCCTCTACCACGTATATGAGGTGAACCT 2429
Query 1353 GGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTACCTGAAGAACGTGCAGACCCAGGAGA 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430 GGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTACCTGAAGAACGTGCAGACCCAGGAGA 2503
Query 1427 CGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCACACCGGCCTCCACGCGGCCCCTGCTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 CGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCACACCGGCCTCCACGCGGCCCCTGCTG 2577
Query 1501 GACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCCATCATCGTGCACTGCAGTGATGGTGC 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 GACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCCATCATCGTGCACTGCAGTGATGGTGC 2651
Query 1575 GGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCATGGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTGACA 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 GGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCATGGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTGACA 2725
Query 1649 TCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCCGCTCTAAGGACCAGTTTGAATTTGCC 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 TCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCCGCTCTAAGGACCAGTTTGAATTTGCC 2799
Query 1723 CTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCCCAG 1773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800 CTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCCCAG 2850