Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11079
Subject:
NM_002846.4
Aligned Length:
979
Identities:
591
Gaps:
388

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MRRPRRPGGLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQARPLLQ  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  VTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPRLRPPEPRPRDRSGLAPKRPGPAGELLLQDIPTG  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  SAPAAQHRLPQPPVGKGGAGASSSLSPLQAELLPPLLEHLLLPPQPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFGSRDGSRV  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 223  SEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPAQLFQDSGLLYLAQELPAPSRARVPRL  296

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 297  PEQGSSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEKPASPAVQPDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKG  370

Query   1  ------------------MEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVL  56
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGRNPGGVVNVGADIKKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVL  444

Query  57  LEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQKPLSLAAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRI  130
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  LEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQKPLSLAAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRI  518

Query 131  RHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLV  204
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  RHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLV  592

Query 205  ALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQ  278
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQ  666

Query 279  ASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKNRH  352
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKNRH  740

Query 353  PDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVE  426
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  PDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVE  814

Query 427  DGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLL  500
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  DGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLL  888

Query 501  DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA  574
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA  962

Query 575  LTAVAEEVNAILKALPQ  591
           |||||||||||||||||
Sbjct 963  LTAVAEEVNAILKALPQ  979