Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11079
• Subject: NM_008985.2
• Aligned Length: 981
• Identities: 542
• Gaps: 390

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MRRPRRPGGSGGSGGSGGLRLLVCLLLLSGRPGGCSAISAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQAGVGQARP  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  LLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQHVISQEMERIPRLRPPEPHPRDRSGLVPRKPGPAGELLTQGN  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  PTGSSPAAQGFPRPAGGGDGAGAGSPLSSLQAELLPPLLEHLLMPPQPPHPALTYEPALLQPYLFHQFGSRDGS  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 223  RGSESSSGVVGVGHLSKAEGPALFSRSASKAILGTHSGHSFGDLTGPSPAQLFQDSGLLYMAQELPVPGRARAP  296

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 297  RLPENGGNRAEDSSEGHEEEVLGGRGEKSPPQAAQPELSLQRLTAVLAGYGVELRQLTPEQFSTLLTLLQLLPK  370

Query   1  -----MEGPV--------------EGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARP-PVTP  54
                .||.|              ...|.||....|...||..||||.|||||||.||...|||....| ....
Sbjct 371  GTGRNLEGAVNVGGADVKKTIQQMQRGDPAEALPPTPSLPGYLTASPASSEVQQVLSPGFPEPPHTPSPLGSSS  444

Query  55  VLLEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQKPLSLAAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTF  128
           ||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445  VLLEKKSPLGQSQPTVVGRPSARPSAEEYGYIVTDQKPLSLVAGVRLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPAVTF  518

Query 129  RIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGL  202
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||..||..|||||||||||||||||||
Sbjct 519  RIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAEVLPRQAHGISPMRSVLLTLVALAGVAGL  592

Query 203  LVALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDA  276
           |||||||||.|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 593  LVALAVALCMRHHSRQRDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGQPEPSRVSSVSSQFSDA  666

Query 277  AQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKN  350
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||
Sbjct 667  AQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCAAAQDESNIKKN  740

Query 351  RHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPL  424
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  RHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPL  814

Query 425  VEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRP  498
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  VEDGVKQCDRYWPDEGSSLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRP  888

Query 499  LLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFE  572
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  LLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFE  962

Query 573  FALTAVAEEVNAILKALPQ  591
           |||||||||||||||||||
Sbjct 963  FALTAVAEEVNAILKALPQ  981