Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11079
• Subject: XM_017004609.2
• Aligned Length: 2940
• Identities: 1773
• Gaps: 1167

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGGCGCCCGCGGCGGCCTGGGGGTCTCGGGGGATCCGGGGGTCTCCGGCTGCTCCTCTGCCTCCTGCTGCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGCAGCCGCCCGGGGGGCTGCAGCGCCGTTAGTGCCCACGGCTGTCTATTTGACCGCAGGCTCTGCTCTCACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGAAGTCTGTATTCAGGATGGCTTGTTTGGGCAGTGCCAGGTGGGAGTGGGGCAGGCCCGGCCCCTTTTGCAA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCACCTCCCCAGTTCTCCAACGCTTACAAGGTGTGCTCCGACAACTCATGTCCCAAGGATTGTCCTGGCACGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TGACCTCACCCAGTATGTGATCTCTCAGGAGATGGAGCGCATCCCCAGGCTTCGCCCCCCAGAGCCCCGTCCAA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GGGACAGGTCTGGCTTGGCACCCAAGAGACCTGGTCCTGCTGGAGAGCTGCTTTTACAGGACATCCCCACTGGC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  TCCGCCCCTGCTGCCCAGCATCGGCTTCCACAACCACCAGTGGGCAAAGGTGGAGCTGGGGCCAGCTCCTCTCT  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  GTCCCCTCTGCAGGCTGAGCTGCTCCCGCCTCTCTTGGAGCACCTGCTGCTGCCCCCACAGCCTCCCCACCCTT  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  CACTGAGTTACGAACCTGCCTTGCTGCAGCCCTACCTGTTCCACCAGTTTGGCTCCCGTGATGGCTCCAGGGTC  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  TCAGAGGGCTCCCCAGGGATGGTCAGTGTCGGCCCCCTGCCCAAGGCTGAAGCCCCTGCCCTCTTCAGCAGAAC  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  TGCCTCCAAGGGCATATTTGGGGACCACCCTGGCCACTCCTACGGGGACCTTCCAGGGCCTTCACCTGCCCAGC  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  TTTTTCAAGACTCTGGGCTGCTCTATCTGGCCCAGGAGTTGCCAGCACCCAGCAGGGCCAGGGTGCCAAGGCTG  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  CCAGAGCAAGGGAGCAGCAGCCGGGCAGAGGACTCCCCAGAGGGCTATGAGAAGGAAGGACTAGGGGATCGTGG  962

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  963  AGAGAAGCCTGCTTCCCCAGCTGTGCAGCCAGCAGATGCGGCTCTGCAGAGGCTGGCCGCTGTGCTGGCGGGCT  1036

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct 1037  ATGGGGTAGAGCTGCGTCAGCTGACCCCTGAGCAGCTCTCCACACTCCTGACCCTGCTGCAGCTACTGCCCAAG  1110

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGGGGCCGGTGGA  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTGCAGGAAGAAATCCGGGAGGGGTTGTAAATGTTGGAGCTGATATCAAGAAAACAATGGAGGGGCCGGTGGA  1184

Query   18  GGGCAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACACCCCACTGCCAGCCCTACCTCCA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACACCCCACTGCCAGCCCTACCTCCA  1258

Query   92  GTGAAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTGCCAGACCCCCTGTGACACCTGTC  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGAAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTGCCAGACCCCCTGTGACACCTGTC  1332

Query  166  CTGCTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGACAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGC  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGACAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGC  1406

Query  240  AGAGGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGGCTGCAGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCC  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAGGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGGCTGCAGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCC  1480

Query  314  TGGCTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGTGTGGTGGGACCAGCCCTCACCTTCCGC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGTGTGGTGGGACCAGCCCTCACCTTCCGC  1554

Query  388  ATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCAGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGA  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCAGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGA  1628

Query  462  AGCACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGAGGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGCACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGAGGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAA  1702

Query  536  CTGCGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCCTGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGCGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCCTGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTG  1776

Query  610  GTGGCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGACAAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGG  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGACAAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGG  1850

Query  684  GCCTGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCGCCAGCACATGGCCACGAAGTCCT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCTGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCGCCAGCACATGGCCACGAAGTCCT  1924

Query  758  TGTTCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGTTCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCC  1998

Query  832  CAGGCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCGGCCCAAGCCAACATGGACATCTC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGGCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCGGCCCAAGCCAACATGGACATCTC  2072

Query  906  CACGGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGACCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACGGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGACCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGG  2146

Query  980  CCCTCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGGAGGGCAACATCAAAAAGAACCGG  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCTCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGGAGGGCAACATCAAAAAGAACCGG  2220

Query 1054  CATCCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CATCCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTA  2294

Query 1128  CATCAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACATAGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CATCAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACATAGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCC  2368

Query 1202  ATACCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCATCGTCATGCTGACCCCGCTGGTG  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATACCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCATCGTCATGCTGACCCCGCTGGTG  2442

Query 1276  GAGGATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCCCTCTACCACGTATATGAGGTGAA  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGGATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCCCTCTACCACGTATATGAGGTGAA  2516

Query 1350  CCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTACCTGAAGAACGTGCAGACCCAGG  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTACCTGAAGAACGTGCAGACCCAGG  2590

Query 1424  AGACGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCACACCGGCCTCCACGCGGCCCCTG  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGACGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCACACCGGCCTCCACGCGGCCCCTG  2664

Query 1498  CTGGACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCCATCATCGTGCACTGCAGTGATGG  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGGACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCCATCATCGTGCACTGCAGTGATGG  2738

Query 1572  TGCGGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCATGGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTG  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGCGGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCATGGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTG  2812

Query 1646  ACATCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCCGCTCTAAGGACCAGTTTGAATTT  1719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ACATCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCCGCTCTAAGGACCAGTTTGAATTT  2886

Query 1720  GCCCTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCCCAG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GCCCTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCCCAG  2940