Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11094
- Subject:
- XM_011533010.3
- Aligned Length:
- 1761
- Identities:
- 1466
- Gaps:
- 294
Alignment
Query 1 ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC 296
|.| |
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATG-----C 4
Query 297 TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 370
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TTTG--TTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 76
Query 371 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 77 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 150
Query 445 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 224
Query 519 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 225 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 298
Query 593 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 372
Query 667 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 446
Query 741 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 520
Query 815 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 594
Query 889 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTTAATTTTCCTGAGAGACCAAGACCTGGTCTCCTCGGTTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTTAATTTTCCTGAGAGACCAAGACCTGGTCTCCTCGGTTC 668
Query 963 AATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 AATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA 742
Query 1037 CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC 816
Query 1111 TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC 890
Query 1185 ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG 964
Query 1259 GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC 1038
Query 1333 ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC 1112
Query 1407 CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT 1186
Query 1481 CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC 1260
Query 1555 AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT 1334
Query 1629 AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA 1408
Query 1703 TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA 1761
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA 1467