Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11094
- Subject:
- XM_017004627.2
- Aligned Length:
- 1761
- Identities:
- 1692
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA 74
Query 75 CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA 148
Query 149 TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT 222
Query 223 CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC 296
Query 297 TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 370
Query 371 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 444
Query 445 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 518
Query 519 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 592
Query 593 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 666
Query 667 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 740
Query 741 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 814
Query 815 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 888
Query 889 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTTAATTTTCCTGAGAGACCAAGACCTGGTCTCCTCGGTTC 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCAC----------------------------------------- 921
Query 963 AATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 922 ----------------------------GAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA 967
Query 1037 CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC 1041
Query 1111 TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC 1115
Query 1185 ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG 1189
Query 1259 GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC 1263
Query 1333 ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC 1337
Query 1407 CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT 1411
Query 1481 CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC 1485
Query 1555 AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486 AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT 1559
Query 1629 AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA 1633
Query 1703 TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA 1761
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA 1692