Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11130
• Subject: NM_001324183.1
• Aligned Length: 1074
• Identities: 838
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGTCGGTG--------GCCGGGCTGAAGAAGCAGTTCCACAAAGCCA------GC------------------  42
            |||  |.||        ||.|||.| ||.|.|||     |..||||.|      ||                  
Sbjct    1  ATG--GATGGAATCTTTGCTGGGAT-AATATGCA-----ATCAAGCTAATAGGTGCCTTACCTGGACCTCCCAA  66

Query   43  CAGCTATTTAGTGAAAAAATAAGTGGTGCTGAAGGAACTAAACTAGACGATGAATTTCTTGACATGGAAAGGAA  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  CAGCTATTTAGTGAAAAAATAAGTGGTGCTGAAGGAACTAAACTAGACGATGAATTTCTTGACATGGAAAGGAA  140

Query  117  AATAGATGTTACCAATAAAGTTGTTGCAGAAATTCTTTCAAAAACCACTGAATATCTTCAGCCAAATCCAGCAT  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  AATAGATGTTACCAATAAAGTTGTTGCAGAAATTCTTTCAAAAACCACTGAATATCTTCAGCCAAATCCAGCAT  214

Query  191  ACAGAGCTAAGCTAGGAATGCTGAACACTGTGTCGAAGATCCGAGGGCAGGTGAAGACCACAGGATACCCGCAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  ACAGAGCTAAGCTAGGAATGCTGAACACTGTGTCGAAGATCCGAGGGCAGGTGAAGACCACAGGATACCCGCAG  288

Query  265  ACGGAAGGCTTGCTGGGGGACTGTATGCTGAAATACGGGAAGGAGCTCGGGGAAGACTCCACCTTTGGCAATGC  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  ACGGAAGGCTTGCTGGGGGACTGTATGCTGAAATACGGGAAGGAGCTCGGGGAAGACTCCACCTTTGGCAATGC  362

Query  339  ATTGATAGAAGTTGGTGAATCCATGAAGCTAATGGCTGAGGTGAAAGACTCTCTTGATATTAATGTAAAGCAAA  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  ATTGATAGAAGTTGGTGAATCCATGAAGCTAATGGCTGAGGTGAAAGACTCTCTTGATATTAATGTAAAGCAAA  436

Query  413  CTTTTATTGATCCACTTCAGTTACTACAAGATAAAGATTTAAAAGAGATCGGGCATCACCTGAAAAAGCTGGAA  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  CTTTTATTGATCCACTTCAGTTACTACAAGATAAAGATTTAAAAGAGATCGGGCATCACCTGAAAAAGCTGGAA  510

Query  487  GGCCGCCGCCTGGATTACGATTATAAAAAGAAACGAGTAGGTAAGATACCAGACGAAGAAGTCAGACAAGCGGT  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  GGCCGCCGCCTGGATTACGATTATAAAAAGAAACGAGTAGGTAAGATACCAGACGAAGAAGTCAGACAAGCGGT  584

Query  561  AGAAAAATTTGAAGAGTCAAAGGAGTTGGCTGAAAGAAGCATGTTTAACTTTTTAGAAAATGATGTAGAACAAG  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  AGAAAAATTTGAAGAGTCAAAGGAGTTGGCTGAAAGAAGCATGTTTAACTTTTTAGAAAATGATGTAGAACAAG  658

Query  635  TCAGCCAGTTGGCTGTGTTCATAGAGGCAGCATTAGACTATCACAGACAGTCCACAGAGATTCTGCAGGAGCTG  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TCAGCCAGTTGGCTGTGTTCATAGAGGCAGCATTAGACTATCACAGACAGTCCACAGAGATTCTGCAGGAGCTG  732

Query  709  CAGAGCAAGCTACAGATGCGAATATCAGCTGCATCCAGTGTCCCCAGACGAGAATACAAGCCAAGGCCTGTGAA  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  CAGAGCAAGCTACAGATGCGAATATCAGCTGCATCCAGTGTCCCCAGACGAGAATACAAGCCAAGGCCTGTGAA  806

Query  783  AAGGAGTTCTAGTGAGCTCAATGGAGTTTCCACCACCTCTGTAGTGAAGACGACAGCCTACAGCAGAC---TGG  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|..|.||..|   |||
Sbjct  807  AAGGAGTTCTAGTGAGCTCAATGGAGTTTCCACCACCTCTGTAGTGAAGACGACAGGTTCTAACATTCCCATGG  880

Query  854  AACCAG--CAGAT-------------------------------------------------------------  864
             |||||  |.|.|                                                             
Sbjct  881  -ACCAGCCCTGCTGTCGTGGTCTCTATGACTTTGAGCCAGAAAACCAAGGAGAATTAGGATTTAAAGAAGGGGA  953

Query  865  --------------------------------------------------------------------------  864
                                                                                      
Sbjct  954  CATCATTACATTAACCAATCAAATAGATGAAAACTGGTATGAAGGAATGATACACGGAGAATCGGGATTCTTCC  1027

Query  865  --------------------------------------  864
                                                  
Sbjct 1028  CCATTAATTACGTGGAAGTGATCGTGCCTTTACCTCAG  1065