Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11131
• Subject: XM_011247261.2
• Aligned Length: 975
• Identities: 785
• Gaps: 99

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGGCAGGCATTCCAGTAAAGGAGCGCGTGAAACTGTCTCAGAACTGGCGGCTGGGGCGCTGCCGAGATCGGAT  74

Query   1  -------------------------ATGCCCTGGATGCAGCTAGAGGATGATTCTCTGTACATATCCCAGGCTA  49
                                    |||||.||||||||||||.||||||.||||||||||.||||.|||||||
Sbjct  75  TCTGCTGAAGTGGAGATATAGTCAGATGCCTTGGATGCAGCTACAGGATGCTTCTCTGTACCTATCACAGGCTA  148

Query  50  ATTTCATCCTGGCCTACCAGTTCCGTCCAGATGGTGCCAGCTTGAATCGTCGGCCTCTGGGAGTCTTTGCTGGG  123
           |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||..|..|||||||..|||||
Sbjct 149  ATTTCATCCTGGCCTACCAGTTCCGCCCGGATGGTGCAAGCTTGAACCGACGGCCCTTCAGAGTCTTCTCTGGG  222

Query 124  CATGATGAGGACGTTTGCCACTTTGTGCTGGCCAACTCGCATATTGTTAGTGCAGGAGGGGATGGGAAGATTGG  197
           ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 223  CATGATGAGGACGTCTGTCACTTTGTGCTGGCCAACTCCCACATCGTCAGTGCAGGAGGAGACGGGAAGATCGG  296

Query 198  CATTCATAAGATTCACAGCACCTTCACTGTCAAGTACTCGGCTCATGAACAGGAGGTGAACTGTGTGGATTGCA  271
           ..||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297  TGTTCACAAGATCCACAGCACCTTCACTGTCAAGTACTCGGCTCACGAGCAGGAGGTGAACTGTGTGGACTGTA  370

Query 272  AAGGGGGCATCATTGTGAGTGGCTCCAGGGACAGGACGGCCAAGGTGTGGCCTTTGGCCTCAGGCCGGCTGGGG  345
           ||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 371  AAGGTGGCATCATTGTGAGTGGCTCCCGGGACAGGACAGCCAAGGTATGGCCTCTGGCCTCGGGCCGGCTGGGG  444

Query 346  CAGTGCTTACACACCATCCAGACTGAAGACCGAGTCTGGTCCATTGCTATCAGCCCATTACTCAGCTCTTTTGT  419
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CAGTGCTTACACACCATCCAGACCGAAGACCGAGTCTGGTCCATTGCTATCAGCCCATTACTCAGCTCTTTTGT  518

Query 420  GACAGGGACGGCTTGTTGCGGGCACTTCTCACCCCTGAGAATCTGGGACCTCAACAGTGGGCAGCTGATGACAC  493
           |||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519  GACTGGAACAGCTTGTTGTGGGCACTTCTCACCTCTGAGAATCTGGGACCTCAACAGTGGGCAGCTGATCACAC  592

Query 494  ACTTGGGCAGTGACTTTCCCCCAGGGGCTGGGGTGCTGGATGTCATGTATGAGTCCCCTTTCACACTGCTGTCC  567
           |..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|..||||||||||||
Sbjct 593  ATCTGGGCAGTGACTTTCCCCCAGGGGCTGGGGTGCTAGATGTCATGTATGAGTCCCCCTCTACACTGCTGTCC  666

Query 568  TGTGGCTATGACACCTATGTTCGCTACTGGGACCTCCGCACCAGCGTCCGGAAATGTGTCATGGAGTGGGAGGA  641
           |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||....||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TGTGGTTATGACACCTATGTTCGCTATTGGGACCTCCGCACAAGTACACGGAAATGTGTCATGGAGTGGGAGGA  740

Query 642  GCCCCACGACAGCACCCTGTACTGCCTGCAGACAGATGGCAACCACCTGCTGGCCACAGGTTCCTCCTACTACG  715
           |||.||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741  GCCTCATGACAGTACCTTCTACTGCCTACAGACAGACGGCAACCACCTGCTGGCCACAGGCTCCTCCTACTACG  814

Query 716  GTGTTGTACGGCCGTGGGACCGGCGTCAAAGGGCCTGCCTGCACGCCTTCCCGCTGACGTCGACTCCCCTCAGC  789
           ||.|.||.||||.|||||||||.||.||..||||.||||||||.||||||.|..||||||||||.||.||||||
Sbjct 815  GTCTCGTGCGGCTGTGGGACCGACGCCAGCGGGCTTGCCTGCATGCCTTCTCATTGACGTCGACCCCACTCAGC  888

Query 790  AGCCCTGTGTACTGCCTGCGTCTCACCACCAAGCATCTCTATGCTGCCCTGTCTTACAACCTCCACGTCCTGGA  863
           ||||||||||||||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 889  AGCCCTGTGTACTGCCTGCGGTTCACCACTAGGCATCTCTATGCTGCGCTGTCTTACAACCTCCACGTCTTAGA  962

Query 864  TTTTCAAAACCCA  876
           .|||||.||||||
Sbjct 963  CTTTCAGAACCCA  975