Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11149
- Subject:
- XM_017019902.1
- Aligned Length:
- 1968
- Identities:
- 1130
- Gaps:
- 837
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 222
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 296
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 370
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 444
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 518
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 592
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 666
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 740
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGG 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 741 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGCAGG 814
Query 773 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 888
Query 847 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 962
Query 921 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 1036
Query 995 AGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTA 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTA 1110
Query 1069 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGA 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGCAAGG---------------- 1168
Query 1143 GAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATC 1216
|.|||
Sbjct 1169 -----TTACT---------------------------------------------------------------- 1173
Query 1217 TGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGC 1290
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1291 AATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCA 1364
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1365 AGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAG 1438
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1439 AGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTAC 1512
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1513 AAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCG 1586
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1587 CAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTG 1660
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1661 TTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCT 1734
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1735 AGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGA 1808
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1809 AGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAG 1882
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1883 ATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
Sbjct 1174 -------------------------------------------- 1173
