Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11206
• Subject: NM_003309.4
• Aligned Length: 1314
• Identities: 1311
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAGCGGCCTGGATGGGGTCAAGAGGACCACTCCCCTCCAAACCCACAGCATCATTATTTCTGACCAAGTCCC  74
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Sbjct    1  ATGAGCGGCCTGGATGGGGTCAAGAGGACCACTCCCCTCCAAACCCACAGCATCATTATTTCTGACCAAGTCCC  74

Query   75  GAGCGACCAGGACGCACACCAGTACCTGAGGCTCCGCGACCAAAGCGAGGCGACACAGGTGATGGCGGAGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCGACCAGGACGCACACCAGTACCTGAGGCTCCGCGACCAAAGCGAGGCGACACAGGTGATGGCGGAGCCGG  148

Query  149  GTGAGGGAGGCTCGGAGACCGTCGCGCTCCCGCCTCCACCGCCTTCAGAGGAGGGGGGCGTACCCCAGGATGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGAGGGAGGCTCGGAGACCGTCGCGCTCCCGCCTCCACCGCCTTCAGAGGAGGGGGGCGTACCCCAGGATGCC  222

Query  223  GCGGGCCGTGGCGGTACTCCCCAGATCCGAGTTGTTGGGGGTCGCGGTCATGTGGCGATCAAAGCCGGGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGGCCGTGGCGGTACTCCCCAGATCCGAGTTGTTGGGGGTCGCGGTCATGTGGCGATCAAAGCCGGGCAGGA  296

Query  297  AGAGGGCCAGCCTCCCGCCGAAGGCCTGGCAGCCGCTTCTGTGGTGATGGCAGCCGACCGCAGCCTGAAAAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGGGCCAGCCTCCCGCCGAAGGCCTGGCAGCCGCTTCTGTGGTGATGGCAGCCGACCGCAGCCTGAAAAAGG  370

Query  371  GCGTTCAGGGTGGAGAGAAGGCCCTAGAAATCTGTGGCGCCCAGAGATCCGCGTCTGAGCTGACGGCGGGGGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGTTCAGGGTGGAGAGAAGGCCCTAGAAATCTGTGGCGCCCAGAGATCCGCGTCTGAGCTGACGGCGGGGGCG  444

Query  445  GAGGCTGAGGCGGAGGAGGTGAAGACAGGAAAGTGCGCCACCGTCTCAGCAGCCGTGGCTGAGAGGGAGAGCGC  518
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Sbjct  445  GAGGCTGAGGCGGAGGAGGTGAAGACAGGAAAGTGCGCCACCGTCTCAGCAGCCGTGGCTGAGAGGGAGAGCGC  518

Query  519  TGAGGTGGTGGTGAAGGAAGGCCTGGCGGAGAAGGAGGTAATGGAGGAGCAGATGGAGGTAGAGGAGCAGCCGC  592
            |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGA---GGTGGTGAAGGAAGGCCTGGCGGAGAAGGAGGTAATGGAGGAGCAGATGGAGGTAGAGGAGCAGCCGC  589

Query  593  CAGAAGGTGAAGAAATAGAAGTGGCGGAGGAGGATAGATTGGAGGAGGAGGCGAGGGAGGAAGAAGGGCCCTGG  666
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Sbjct  590  CAGAAGGTGAAGAAATAGAAGTGGCGGAGGAGGATAGATTGGAGGAGGAGGCGAGGGAGGAAGAAGGGCCCTGG  663

Query  667  CCTTTGCATGAGGCTCTCCGCATGGACCCTCTGGAGGCCATCCAGCTGGAACTGGACACTGTGAATGCTCAGGC  740
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Sbjct  664  CCTTTGCATGAGGCTCTCCGCATGGACCCTCTGGAGGCCATCCAGCTGGAACTGGACACTGTGAATGCTCAGGC  737

Query  741  CGACAGGGCCTTCCAACAGCTGGAGCACAAGTTTGGGCGGATGCGTCGACACTACCTGGAGCGGAGGAACTACA  814
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Sbjct  738  CGACAGGGCCTTCCAACAGCTGGAGCACAAGTTTGGGCGGATGCGTCGACACTACCTGGAGCGGAGGAACTACA  811

Query  815  TCATTCAGAATATCCCGGGCTTCTGGATGACTGCTTTTCGAAACCACCCCCAGTTGTCCGCCATGATTAGGGGC  888
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Sbjct  812  TCATTCAGAATATCCCGGGCTTCTGGATGACTGCTTTTCGAAACCACCCCCAGTTGTCCGCCATGATTAGGGGC  885

Query  889  CAAGATGCAGAGATGTTAAGGTACATAACCAATTTAGAGGTGAAGGAACTCAGACACCCTAGAACCGGTTGCAA  962
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Sbjct  886  CAAGATGCAGAGATGTTAAGGTACATAACCAATTTAGAGGTGAAGGAACTCAGACACCCTAGAACCGGTTGCAA  959

Query  963  GTTCAAGTTCTTCTTTAGAAGAAACCCCTACTTCAGAAACAAGCTGATTGTCAAGGAATATGAGGTAAGATCCT  1036
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Sbjct  960  GTTCAAGTTCTTCTTTAGAAGAAACCCCTACTTCAGAAACAAGCTGATTGTCAAGGAATATGAGGTAAGATCCT  1033

Query 1037  CCGGCCGAGTGGTGTCTCTTTCTACTCCAATTATATGGCGCAGGGGGCATGAACCCCAGTCCTTCATTCGCAGA  1110
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Sbjct 1034  CCGGCCGAGTGGTGTCTCTTTCTACTCCAATTATATGGCGCAGGGGGCATGAACCCCAGTCCTTCATTCGCAGA  1107

Query 1111  AACCAAGACCTCATCTGCAGCTTCTTCACTTGGTTTTCAGACCACAGCCTTCCAGAGTCCGACAAAATTGCTGA  1184
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Sbjct 1108  AACCAAGACCTCATCTGCAGCTTCTTCACTTGGTTTTCAGACCACAGCCTTCCAGAGTCCGACAAAATTGCTGA  1181

Query 1185  GATTATTAAAGAGGATCTGTGGCCAAATCCACTGCAATACTACCTGTTGCGTGAAGGAGTCCGTAGAGCCCGAC  1258
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Sbjct 1182  GATTATTAAAGAGGATCTGTGGCCAAATCCACTGCAATACTACCTGTTGCGTGAAGGAGTCCGTAGAGCCCGAC  1255

Query 1259  GTCGCCCGCTAAGGGAGCCTGTAGAGATCCCCAGGCCCTTTGGGTTCCAGTCTGGT  1314
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Sbjct 1256  GTCGCCCGCTAAGGGAGCCTGTAGAGATCCCCAGGCCCTTTGGGTTCCAGTCTGGT  1311