Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11207
• Subject: NM_003315.4
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1452
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA  74

Query   45  GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT  148

Query  119  ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  222

Query  193  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  296

Query  267  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  370

Query  341  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  444

Query  415  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  518

Query  489  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  592

Query  563  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  666

Query  637  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  740

Query  711  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  814

Query  785  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  888

Query  859  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  962

Query  933  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  1036

Query 1007  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  1110

Query 1081  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1184

Query 1155  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1258

Query 1229  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1332

Query 1303  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1406

Query 1377  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1480

Query 1451  GC  1452
            ||
Sbjct 1481  GC  1482