Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11207
• Subject: XM_011525168.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1314
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATTATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTA  148
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGTGTCCTA  10

Query  149  AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT  84

Query  223  GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT  158

Query  297  GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC  232

Query  371  AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT  306

Query  445  CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC  380

Query  519  AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA  454

Query  593  CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT  528

Query  667  TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA  602

Query  741  AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG  676

Query  815  CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG  750

Query  889  CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA  824

Query  963  CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC  898

Query 1037  AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA  972

Query 1111  GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC  1046

Query 1185  CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG  1120

Query 1259  AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT  1194

Query 1333  GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT  1268

Query 1407  CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269  CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC  1314