Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11241
• Subject: NM_001320952.1
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1224
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGGGGGCCCTTGCAAGATTCCAGCTGGTATGAGCCTTCTGCAGAGCTAGTGCA  74

Query    1  -------ATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGA  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACTAGGATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGA  148

Query   68  TGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGT  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGT  222

Query  142  CAAGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCA  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCA  296

Query  216  ACTACGAGTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGC  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTACGAGTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGC  370

Query  290  TGGAACAATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAACAATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAG  444

Query  364  GAGGCTGTGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGG  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCTGTGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGG  518

Query  438  ACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCC  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCC  592

Query  512  AGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                           |||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGT---------------------------GTTGTTACAGAAGAT  639

Query  586  GGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGA  713

Query  660  AAAACTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  AAAACTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCA  787

Query  734  AAGCGGAGAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATT  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  AAGCGGAGAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATT  861

Query  808  CCCACAGGGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  CCCACAGGGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCA  935

Query  882  CCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACC  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  CCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACC  1009

Query  956  TCGGTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  TCGGTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGG  1083

Query 1030  GGTGCTCATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGC  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  GGTGCTCATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGC  1157

Query 1104  CTTTAGTCAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAAT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CTTTAGTCAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAAT  1231

Query 1178  GTGGGAAAGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  GTGGGAAAGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1305