Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11241
- Subject:
- XM_011524006.3
- Aligned Length:
- 1251
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGATGATGAT 74
|||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGATGATGAT 11
Query 75 GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA 85
Query 149 TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA 159
Query 223 GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA 233
Query 297 ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTG 307
Query 371 TGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 TGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA 381
Query 445 CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA 455
Query 519 GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGATGGCCCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGATGGCCCAG 529
Query 593 AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT 603
Query 667 GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA 677
Query 741 GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG 751
Query 815 GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA 825
Query 889 GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA 899
Query 963 GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC 973
Query 1037 ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT 1047
Query 1111 CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA 1121
Query 1185 AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT 1251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT 1188