Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11249
- Subject:
- NR_161422.1
- Aligned Length:
- 2093
- Identities:
- 1558
- Gaps:
- 535
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 74
Query 35 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 148
Query 109 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACA-------------------------------- 190
Query 183 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 256
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 ---------------------------------------------------GATATTTGAATGGTGGTATTTTC 213
Query 257 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 287
Query 331 AACTCTTCCAACA---------------------ACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 383
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 361
Query 384 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 435
Query 458 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 509
Query 532 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 583
Query 606 CTTGGAGATAAATG------------------------------------------------------------ 619
||||||||||||||
Sbjct 584 CTTGGAGATAAATGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATCTGGGAGATAAAAT 657
Query 620 ---------AGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TGTTACCAAAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 731
Query 685 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 805
Query 759 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 879
Query 833 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 953
Query 907 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 1027
Query 981 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1101
Query 1055 CTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATT 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 CTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATT 1175
Query 1129 CATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGA 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 CATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGA 1249
Query 1203 ACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGG 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 ACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGG 1323
Query 1277 AAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 AAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGG 1397
Query 1351 CACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTC 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTC 1471
Query 1425 AGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 AGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGG 1545
Query 1499 CCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCC 1572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCC 1619
Query 1573 TTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC----- 1641
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATCTGAGA 1693
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1694 GAAGCCCTGTCCTCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTGGACCGCAAG 1767
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1768 AAAGCATGACTTTGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATATTAAAAGCTG 1841
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1842 TTTTTGTTGTACAAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATA 1915
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1916 AAACTTTTGTGTATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGATGTCCCAAAT 1989
Query 1642 --------------------- 1641
Sbjct 1990 AAACCTTTGGATTTACCTTGA 2010