Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11269
• Subject: XM_006526763.3
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1337
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAGACACA  74
            |||||.||..||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||     
Sbjct    1  ATGTCGTCAACTGCTGAAAATGGAGACGCCGTACCTGGAAAACAAAACGAAGAAAAAACCTACAAAAAG-----  69

Query   75  AGTGAAAAACCAAATCCTGTCTCGTTTACCCAAGATTCCGTGTACATTCATTCAAGCATGGACCAACACAGAGA  148
                                                                                      
Sbjct   70  --------------------------------------------------------------------------  69

Query  149  TGATTACGTTGCTAGCCTGTTATTACTTCAGATCAGTTTCAACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG  222
                                                     ||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct   70  -----------------------------------------ACGGCATCGTCAGCTATTAAAGGTGCTATCCAG  102

Query  223  CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT  296
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  103  CTGGGAATAGGATACACAGTGGGCAACCTCACGTCCAAGCCAGAACGCGATGTCCTCATGCAAGACTTCTACGT  176

Query  297  GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA  370
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  177  GGTGGAAAGTGTGTTCCTCCCCAGTGAAGGGAGCAACCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTCAGGTTTA  250

Query  371  AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC  444
            ||||.|||||.||..|.||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  251  AGACCTACGCACCGCTGGCCTTCCGGTACTTCCGAGAACTCTTTGGTATCAAGCCCGATGATTACTTGTACTCC  324

Query  445  ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||
Sbjct  325  ATCTGCAGTGAACCTCTGATAGAACTGTCCAATCCTGGAGCCAGTGGGTCCTTGTTTTTCTTGACCAGCGATGA  398

Query  519  TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA  592
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  399  TGAATTTATCATCAAAACCGTTCAGCATAAGGAAGCCGAGTTCCTGCAGAAGCTGCTGCCGGGCTATTACATGA  472

Query  593  ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct  473  ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTCTGCCAAAATTCTATGGGCTGTATTGCATGCAGTCAGGAGGCATCAAC  546

Query  667  ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC  740
            |||.|.|||||||||||||||||.||..||||.||..|||||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||
Sbjct  547  ATCCGCATTGTGGTGATGAACAATGTCCTGCCGCGTGCCATGAGGATGCATTTGACCTATGACCTGAAAGGCTC  620

Query  741  AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC  814
            .||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||
Sbjct  621  CACATACAAGCGAAGAGCATCCCGAAAAGAGAGGGAGAAACCCAACCCCACGTTTAAGGACCTGGACTTCCTGC  694

Query  815  AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC  888
            |.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  695  AGGACATGCACGAGGGGCTGTATTTCGATACAGAAACATACAATGCCCTTATGAAGACACTACAGAGAGACTGC  768

Query  889  CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA  962
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||.||.||||.||.||..||.||||||||||||||||
Sbjct  769  CGGGTTCTGGAAAGCTTCAAGATCATGGACTACAGCCTTTTGCTGGGTATCCACATCTTGGACCATTCCCTCAA  842

Query  963  AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA  1036
            |||.|||||.||||||.|||..|||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  843  AGACAAAGAAGAGGAGCCCCTCCAAAACGTGCCTGATGCAAAGCGGCCGGGGATGCAGAAAGTCCTCTATTCCA  916

Query 1037  CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA  1110
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|||||||||.||..|||||||.|||||||||||||||
Sbjct  917  CAGCCATGGAATCCATCCAGGGTCCAGGCAAGTCTGCAGATGGGATCATTGCAGAGAATCCAGACACAATGGGA  990

Query 1111  GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTACGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA  1184
            ||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||.||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  991  GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAAGGGAGAGAAGCTGCTTCTATTCATGGGCATTATTGACATCCTCCAATCATA  1064

Query 1185  TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1065  TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCCCTTGTTTATGATGGGGACACCGTTTCAGTTCATAGAC  1138

Query 1259  CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT  1332
            ||||.|||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.
Sbjct 1139  CAAGTTTTTATGCAGATAGATTTTTAAAGTTTATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTCTGAAAGCC  1212

Query 1333  TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG  1406
            ||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1213  TCGCCTTCTAAGAAACGCTGCAACTCCATCGCTGCACTGAAGGCAACCTCCCAGGAGATCGTATCCTCCATCAG  1286

Query 1407  CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC  1480
            |||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1287  CCAGGAATGGAAGGACGAGAAGCGGGATTTGTTAACCGAAGGACAGAGTTTCAGCAGCCTGGATGAAGAAGCCC  1360

Query 1481  TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA  1554
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1361  TGGGATCCCGACACAGGCCCGACCTGGTACCCAGCACTCCATCATTATTTGAAGCTGCTTCCTTAGCGACCACA  1434

Query 1555  ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAG------  1622
            ||.|||||||||||||||||.|||...||.|||||||||||.||||||.||||.||.||.||||||||      
Sbjct 1435  ATATCATCTTCTTCCTTATATGTCGGCGAACACTATCCACATGACAGGACTACCCTTTACTCAAACAGCAAAGG  1508

Query 1623  -----------GTTC--------------AAGATGGCAACAT-----------CAGAGCAT-------------  1647
                       ||||              ||||.||.|.|||           |.||||..             
Sbjct 1509  GTTACCTTCCAGTTCAACCTTCACCTTGGAAGAGGGGACCATCTACCTGACGGCTGAGCCAAACACCCTGGACC  1582

Query 1648  -----------------------------------  1647
                                               
Sbjct 1583  TGCAGGATGATGCCTCTGTGCTGGACGTCTATTTA  1617