Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11312
- Subject:
- NM_003889.3
- Aligned Length:
- 1302
- Identities:
- 1134
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTGGAGGTGAGACCCAAAGAAAGCTGGAACCATGCTGACTTTGTACACTGTGAGGACACAGAGTCTGTTCCTGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAAGCCCAGTGTCAACGCAGATGAGGAAGTCGGAGGTCCCCAAATCTGCCGTGTATGTGGGGACAAGGCCACTG 148
Query 1 -----------------ATGACATGTGAAGGATGCAAGGGCTTTTTCAGGAGGGCCATGAAACGCAACGCCCGG 57
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTATCACTTCAATGTCATGACATGTGAAGGATGCAAGGGCTTTTTCAGGAGGGCCATGAAACGCAACGCCCGG 222
Query 58 CTGAGGTGCCCCTTCCGGAAGGGCGCCTGCGAGATCACCCGGAAGACCCGGCGACAGTGCCAGGCCTGCCGCCT 131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGAGGTGCCCCTTCCGGAAGGGCGCCTGCGAGATCACCCGGAAGACCCGGCGACAGTGCCAGGCCTGCCGCCT 296
Query 132 GCGCAAGTGCCTGGAGAGCGGCATGAAGAAGGAGATGATCATGTCCGACGAGGCCGTGGAGGAGAGGCGGGCCT 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCGCAAGTGCCTGGAGAGCGGCATGAAGAAGGAGATGATCATGTCCGACGAGGCCGTGGAGGAGAGGCGGGCCT 370
Query 206 TGATCAAGCGGAAGAAAAGTGAACGGACAGGGACTCAGCCACTGGGAGTGCAGGGGCTGACAGAGGAGCAGCGG 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGATCAAGCGGAAGAAAAGTGAACGGACAGGGACTCAGCCACTGGGAGTGCAGGGGCTGACAGAGGAGCAGCGG 444
Query 280 ATGATGATCAGGGAGCTGATGGACGCTCAGATGAAAACCTTTGACACTACCTTCTCCCATTTCAAGAATTTCCG 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGATGATCAGGGAGCTGATGGACGCTCAGATGAAAACCTTTGACACTACCTTCTCCCATTTCAAGAATTTCCG 518
Query 354 ---GCCAGGGGTGCTTAGCAGTGGCTGCGAGTTGCCAGAGTCTCTGCAGGCCCCATCGAGGGAAGAAGCTGCCA 424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGCCAGGGGTGCTTAGCAGTGGCTGCGAGTTGCCAGAGTCTCTGCAGGCCCCATCGAGGGAAGAAGCTGCCA 592
Query 425 AGTGGAGCCAGGTCCGGAAAGATCTGTGCTCTTTGAAGGTCTCTCTGCAGCTGCGGGGGGAGGATGGCAGTGTC 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTGGAGCCAGGTCCGGAAAGATCTGTGCTCTTTGAAGGTCTCTCTGCAGCTGCGGGGGGAGGATGGCAGTGTC 666
Query 499 TGGAACTACAAACCCCCAGCCGACAGTGGCGGGAAAGAGATCTTCTCCCTGCTGCCCCACATGGCTGACATGTC 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGAACTACAAACCCCCAGCCGACAGTGGCGGGAAAGAGATCTTCTCCCTGCTGCCCCACATGGCTGACATGTC 740
Query 573 AACCTACATGTTCAAAGGCATCATCAGCTTTGCCAAAGTCATCTCCTACTTCAGGGACTTGCCCATCGAGGACC 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACCTACATGTTCAAAGGCATCATCAGCTTTGCCAAAGTCATCTCCTACTTCAGGGACTTGCCCATCGAGGACC 814
Query 647 AGATCTCCCTGCTGAAGGGGGCCGCTTTCGAGCTGTGTCAACTGAGATTCAACACAGTGTTCAACGCGGAGACT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGATCTCCCTGCTGAAGGGGGCCGCTTTCGAGCTGTGTCAACTGAGATTCAACACAGTGTTCAACGCGGAGACT 888
Query 721 GGAACCTGGGAGTGTGGCCGGCTGTCCTACTGCTTGGAAGACACTGCAGGTGGCTTCCAGCAACTTCTACTGGA 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAACCTGGGAGTGTGGCCGGCTGTCCTACTGCTTGGAAGACACTGCAGGTGGCTTCCAGCAACTTCTACTGGA 962
Query 795 GCCCATGCTGAAATTCCACTACATGCTGAAGAAGCTGCAGCTGCATGAGGAGGAGTATGTGCTGATGCAGGCCA 868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCCATGCTGAAATTCCACTACATGCTGAAGAAGCTGCAGCTGCATGAGGAGGAGTATGTGCTGATGCAGGCCA 1036
Query 869 TCTCCCTCTTCTCCCCAGACCGCCCAGGTGTGCTGCAGCACCGCGTGGTGGACCAGCTGCAGGAGCAATTCGCC 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTCCCTCTTCTCCCCAGACCGCCCAGGTGTGCTGCAGCACCGCGTGGTGGACCAGCTGCAGGAGCAATTCGCC 1110
Query 943 ATTACTCTGAAGTCCTACATTGAATGCAATCGGCCCCAGCCTGCTCATAGGTTCTTGTTCCTGAAGATCATGGC 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTACTCTGAAGTCCTACATTGAATGCAATCGGCCCCAGCCTGCTCATAGGTTCTTGTTCCTGAAGATCATGGC 1184
Query 1017 TATGCTCACCGAGCTCCGCAGCATCAATGCTCAGCACACCCAGCGGCTGCTGCGCATCCAGGACATACACCCCT 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATGCTCACCGAGCTCCGCAGCATCAATGCTCAGCACACCCAGCGGCTGCTGCGCATCCAGGACATACACCCCT 1258
Query 1091 TTGCTACGCCCCTCATGCAGGAGTTGTTCGGCATCACAGGTAGC 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTGCTACGCCCCTCATGCAGGAGTTGTTCGGCATCACAGGTAGC 1302