Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11339
- Subject:
- NM_004697.4
- Aligned Length:
- 1566
- Identities:
- 1563
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCAC---GGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT 71
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCACGCAGGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT 74
Query 72 GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA 148
Query 146 TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA 222
Query 220 ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT 296
Query 294 CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG 370
Query 368 AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC 444
Query 442 AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG 518
Query 516 CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC 592
Query 590 TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT 666
Query 664 AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC 740
Query 738 CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC 814
Query 812 ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG 888
Query 886 GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG 962
Query 960 CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT 1036
Query 1034 CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC 1110
Query 1108 ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG 1184
Query 1182 CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT 1258
Query 1256 ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC 1332
Query 1330 ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC 1406
Query 1404 CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA 1480
Query 1478 AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG 1554
Query 1552 TGGATGGCTGAA 1563
||||||||||||
Sbjct 1555 TGGATGGCTGAA 1566