Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: NM_001330570.2
• Aligned Length: 1146
• Identities: 912
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATC----------------------------------  114

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222
                                                                                      
Sbjct  115  --------------------------------------------------------------------------  114

Query  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  ---------GATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  179

Query  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  253

Query  371  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  327

Query  445  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGA-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  328  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGGTGGCAGTTCTCATTCCTTTCCGTAATCGCCATGAACATCTTCCAAT  401

Query  470  --------------------------------------------------------------------AGACTG  475
                                                                                ||||||
Sbjct  402  TTTTTTCTTACATCTGATTCCAATGCTCCAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTGAACAGACTG  475

Query  476  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  549

Query  550  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  623

Query  624  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  697

Query  698  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  771

Query  772  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  845

Query  846  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  919

Query  920  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  993

Query  994  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029