Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: NM_004775.4
• Aligned Length: 1146
• Identities: 1029
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222

Query  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296

Query  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  370

Query  371  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  444

Query  445  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGA-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  445  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGGTGGCAGTTCTCATTCCTTTCCGTAATCGCCATGAACATCTTCCAAT  518

Query  470  --------------------------------------------------------------------AGACTG  475
                                                                                ||||||
Sbjct  519  TTTTTTCTTACATCTGATTCCAATGCTCCAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTGAACAGACTG  592

Query  476  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  666

Query  550  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  740

Query  624  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  814

Query  698  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  888

Query  772  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  962

Query  846  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  1036

Query  920  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  1110

Query  994  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1146