Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: XM_006722578.3
• Aligned Length: 1146
• Identities: 915
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222

Query  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296
            ||||||||||                                                                
Sbjct  223  AACGGTACAG----------------------------------------------------------------  232

Query  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  370
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  --------------------------------------------------GAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  256

Query  371  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  330

Query  445  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGA-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  331  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGGTGGCAGTTCTCATTCCTTTCCGTAATCGCCATGAACATCTTCCAAT  404

Query  470  --------------------------------------------------------------------AGACTG  475
                                                                                ||||||
Sbjct  405  TTTTTTCTTACATCTGATTCCAATGCTCCAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTGAACAGACTG  478

Query  476  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  552

Query  550  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  626

Query  624  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  700

Query  698  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  774

Query  772  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  848

Query  846  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  922

Query  920  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  996

Query  994  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1032