Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: XM_006722579.4
• Aligned Length: 1146
• Identities: 897
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATGGTACAAGCTCGAG  16

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   17  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  90

Query  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  164

Query  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGGATTCCTCAATGTCAATGTAA  238

Query  371  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  GCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCATCAACTCTTCTCCAAGGATTTAGATATTGAGCCAGGGGGTCATTGGAGG  312

Query  445  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGA-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  313  CCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGGTGGCAGTTCTCATTCCTTTCCGTAATCGCCATGAACATCTTCCAAT  386

Query  470  --------------------------------------------------------------------AGACTG  475
                                                                                ||||||
Sbjct  387  TTTTTTCTTACATCTGATTCCAATGCTCCAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTGAACAGACTG  460

Query  476  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  GCACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGAC  534

Query  550  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  TGTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACG  608

Query  624  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  TCATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGC  682

Query  698  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  TGACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGAC  756

Query  772  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  CTTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAAT  830

Query  846  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  TCCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGT  904

Query  920  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  ACATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTA  978

Query  994  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  AACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1014