Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: XM_017026090.1
• Aligned Length: 1071
• Identities: 756
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTG-TACACAAATAAAAACAGTACGCT  221
                                         || |.|.|| ||..|..|||| |||           ||.|| || 
Sbjct    1  -----------------------------AT-GCTTAT-TGCACTTGCTGCTAC-----------CACTA-GC-  30

Query  222  CAACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAA  295
                    .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  --------AAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAA  96

Query  296  ACTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGG--------ATTCCTCAATG  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||        |||||    |.
Sbjct   97  ACTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGTGGCAGTTCTCATTCC----TT  166

Query  362  TCAATGTAAGCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCAT-CAACTCTTCTCCAAGGATTTAGAT---ATT--------  423
            ||  .||||.||          ..|||||..||.| |||.|.||.||       |||.||   |||        
Sbjct  167  TC--CGTAATCG----------CCATGAACATCTTCCAATTTTTTTC-------TTACATCTGATTCCAATGCT  221

Query  424  ---GAGCCAGGGG------------------GTCATTGGAGGCCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGACTGG  476
               ||..|||.||                  |||||||                 |||         |||||||
Sbjct  222  CCAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTG-----------------AAC---------AGACTGG  269

Query  477  CACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGACT  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  CACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGACT  343

Query  551  GTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACGT  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  GTGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACGT  417

Query  625  CATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGCT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  CATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGCT  491

Query  699  GACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGACC  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGACC  565

Query  773  TTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAATT  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  TTTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAATT  639

Query  847  CCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGTA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  CCTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGTA  713

Query  921  CATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTAA  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  CATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTAA  787

Query  995  ACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  ACCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  822