Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11358
• Subject: XM_017026091.1
• Aligned Length: 1070
• Identities: 750
• Gaps: 304

Alignment

Query    1  ATGTCTGTGCTCAGGCGGATGATGCGGGTTTCCAATCGCTCTCTCCTCGCCTTCATCTTCTTCTTCTCCCTCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCGTCCTGTCTGTACTTCATCTATGTGGCCCCAGGCATCGCCAACACATATCTCTTTATGGTACAAGCTCGAG  148
                                   |||||||||||||||||                                  
Sbjct    1  -----------------------ATGTGGCCCCAGGCATC----------------------------------  17

Query  149  GTATAATGTTGAGAGAAAATGTGAAAACAATAGGTCATATGATCAGGCTGTACACAAATAAAAACAGTACGCTC  222
                                                                                      
Sbjct   18  --------------------------------------------------------------------------  17

Query  223  AACGGTACAGATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  ---------GATTATCCCGAAGGCAATAATTCAAGTGATTATCTTGTTCAAACAACAACGTATCTCCCGGAAAA  82

Query  297  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGAGG--------ATTCCTCAATGT  362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||        |||||    |.|
Sbjct   83  CTTCACATACTCACCATACCTCCCCTGTCCAGAAAAGCTGCCTTATATGCGTGGCAGTTCTCATTCC----TTT  152

Query  363  CAATGTAAGCGAAGTCAGTTTTGATGAAATTCAT-CAACTCTTCTCCAAGGATTTAGAT---ATT---------  423
            |  .||||.||          ..|||||..||.| |||.|.||.||       |||.||   |||         
Sbjct  153  C--CGTAATCG----------CCATGAACATCTTCCAATTTTTTTC-------TTACATCTGATTCCAATGCTC  207

Query  424  --GAGCCAGGGG------------------GTCATTGGAGGCCAAAAGACTGTAAACCCAGATGGAAGACTGGC  477
              ||..|||.||                  |||||||                 |||         ||||||||
Sbjct  208  CAGAAGCAGCGGCTGGAATTTGCGTTTTATGTCATTG-----------------AAC---------AGACTGGC  255

Query  478  ACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGACTG  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  ACACAACCTTTTAACCGTGCGATGCTTTTCAATGTGGGCTTCAAAGAGGCCATGAAAGACAGTGTCTGGGACTG  329

Query  552  TGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACGTC  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  TGTAATCTTCCACGATGTGGATCATCTACCTGAAAATGACCGGAACTATTACGGATGTGGAGAAATGCCACGTC  403

Query  626  ATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGCTG  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  ATTTTGCTGCAAAGCTGGATAAATACATGTATATTCTTCCATATAAAGAATTTTTTGGTGGTGTAAGTGGGCTG  477

Query  700  ACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGACCT  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  ACAGTGGAACAATTTAGAAAGATCAATGGTTTTCCTAATGCCTTCTGGGGATGGGGAGGAGAAGATGATGACCT  551

Query  774  TTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAATTC  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  TTGGAACAGAGTTCACTATGCTGGATATAATGTAACCAGACCAGAGGGAGACTTAGGAAAATACAAGTCAATTC  625

Query  848  CTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGTAC  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  CTCATCACCATAGAGGTGAAGTCCAGTTTTTAGGACGGTATAAATTACTAAGGTATTCCAAGGAGCGTCAGTAC  699

Query  922  ATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTAAA  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  ATCGATGGACTGAACAATTTAATATATAGGCCAAAAATACTGGTTGATAGGTTGTATACAAACATATCTGTAAA  773

Query  996  CCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  CCTCATGCCAGAGTTAGCTCCAATCGAAGACTAT  807