Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11425
• Subject: NM_001282984.2
• Aligned Length: 1946
• Identities: 1905
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGATAGAAGGAACATACAGAGTCCTGCAGACTGCAGGGATGCGCTTGGGTGCCCAGACCCCTGTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGATAGAAGGAACATACAGAGTCCTGCAGACTGCAGGGATGCGCTTGGGTGCCCAGACCCCTGTGGG  74

Query   75  AGTTAGCACCCTTGAGCCTGGGCAGACTCTCTTGCCCAGAATGCAAGAGAAGCACCTGCACCTCAGAGTAAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTAGCACCCTTGAGCCTGGGCAGACTCTCTTGCCCAGAATGCAAGAGAAGCACCTGCACCTCAGAGTAAAGC  148

Query  149  TGCTGGACAACACCATGGAAATATTTGACATTGAGCCTAAATGCGATGGCCAGGTATTACTGACACAAGTGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGGACAACACCATGGAAATATTTGACATTGAGCCTAAATGCGATGGCCAGGTATTACTGACACAAGTGTGG  222

Query  223  AAGCGTTTAAACCTGGTAGAATGTGACTACTTCGGGATGGAGTTTCAAAATACTCAGTCCTACTGGATTTGGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCGTTTAAACCTGGTAGAATGTGACTACTTCGGGATGGAGTTTCAAAATACTCAGTCCTACTGGATTTGGCT  296

Query  297  TGAACCTATGAAACCCATCATTAGGCAAATACGAAGGCCAAAGAATGTGGTGCTTCGCCTAGCTGTAAAATTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAACCTATGAAACCCATCATTAGGCAAATACGAAGGCCAAAGAATGTGGTGCTTCGCCTAGCTGTAAAATTTT  370

Query  371  TTCCACCTGATCCTGGTCAGCTACAAGAAGAATATACAAGATACTTGTTTGCCTTGCAACTTAAGAGAGACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCACCTGATCCTGGTCAGCTACAAGAAGAATATACAAGATACTTGTTTGCCTTGCAACTTAAGAGAGACCTG  444

Query  445  CTGGAAGAGCGTTTGACCTGTGCTGACACCACAGCGGCCCTTCTCACGTCCCATCTCCTGCAGTCGGAAATAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAAGAGCGTTTGACCTGTGCTGACACCACAGCGGCCCTTCTCACGTCCCATCTCCTGCAGTCGGAAATAGG  518

Query  519  AGATTACGATGAAACGCTGGACCGAGAGCACCTCAAAGTGAACGAGTATTTGCCTGGCCAGCAGCACTGCCTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATTACGATGAAACGCTGGACCGAGAGCACCTCAAAGTGAACGAGTATTTGCCTGGCCAGCAGCACTGCCTTG  592

Query  593  AGAAGATACTAGAATTCCATCAGAAGCACGTGGGCCAGACACCTGCTGAGTCGGATTTCCAGGTGCTCGAAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGATACTAGAATTCCATCAGAAGCACGTGGGCCAGACACCTGCTGAGTCGGATTTCCAGGTGCTCGAAATT  666

Query  667  GCTCGAAAGTTGGAAATGTACGGCATCAGATTTCACATGGCTTCTGACAGGGAAGGAACCAAGATTCAACTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTCGAAAGTTGGAAATGTACGGCATCAGATTTCACATGGCTTCTGACAGGGAAGGAACCAAGATTCAACTGGC  740

Query  741  AGTTTCCCACATGGGTGTACTCGTGTTCCAGGGCACCACCAAAATCAACACTTTCAACTGGTCCAAGGTCCGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTTCCCACATGGGTGTACTCGTGTTCCAGGGCACCACCAAAATCAACACTTTCAACTGGTCCAAGGTCCGTA  814

Query  815  AACTAAGCTTCAAGAGGAAAAGATTTCTTATCAAACTTCATCCAGAGGTTCATGGACCTTACCAGGACACATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACTAAGCTTCAAGAGGAAAAGATTTCTTATCAAACTTCATCCAGAGGTTCATGGACCTTACCAGGACACATTA  888

Query  889  GAATTTTTGTTGGGTAGTAGAGATGAATGTAAGAACTTCTGGAAGATTTGTGTGGAGTATCACACCTTTTTTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTTTTGTTGGGTAGTAGAGATGAATGTAAGAACTTCTGGAAGATTTGTGTGGAGTATCACACCTTTTTTAG  962

Query  963  ACTTTTGGACCAACCTAAGCCAAAAGCAAAAGCCGTCTTCTTCAGCCGGGGCTCCTCCTTCAGATACAGTGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTTTTGGACCAACCTAAGCCAAAAGCAAAAGCCGTCTTCTTCAGCCGGGGCTCCTCCTTCAGATACAGTGGAA  1036

Query 1037  GAACTCAGAAACAACTAGTAGATTATTTCAAAGACAGTGGAATGAAGAGAATTCCATATGAAAGAAGGCACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAACTCAGAAACAACTAGTAGATTATTTCAAAGACAGTGGAATGAAGAGAATTCCATATGAAAGAAGGCACAGC  1110

Query 1111  AAGACCCACACGTCCGTTCGAGCTCTGACTGCAGACCTACCAAAACAGAGCATCTCATTCCCCGAGGGATTGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGACCCACACGTCCGTTCGAGCTCTGACTGCAGACCTACCAAAACAGAGCATCTCATTCCCCGAGGGATTGAG  1184

Query 1185  GACTCCTGCCTCCCCATCTTCAGCGAATGCCTTTTACTCGCTCTCTCCCTCCACTCTGGTCCCCTCTGGCCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACTCCTGCCTCCCCATCTTCAGCGAATGCCTTTTACTCGCTCTCTCCCTCCACTCTGGTCCCCTCTGGCCTGC  1258

Query 1259  CAGAGTTTAAGGACAGCAGCAGCTCCCTCACAGATCCCCAGGTTTCCTACGTCAAGAGTCCAGCTGCAGAGAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGTTTAAGGACAGCAGCAGCTCCCTCACAGATCCCCAGGTTTCCTACGTCAAGAGTCCAGCTGCAGAGAGG  1332

Query 1333  CGCAGTGGAGCAGTGGCTGGAGGCCCCGACACACCATCGGCCCAGCCCCTCGGGCCCCCCGCACTCCAGCCTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCAGTGGAGCAGTGGCTGGAGGCCCCGACACACCATCGGCCCAGCCCCTCGGGCCCCCCGCACTCCAGCCTGG  1406

Query 1407  TCCAGGCCTTTCCACGAAGAGTCCTCAGCCTTCTCCCTCCAGCCGGAAGAGCCCCCTGAGTCTGAGCCCTGCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCAGGCCTTTCCACGAAGAGTCCTCAGCCTTCTCCCTCCAGCCGGAAGAGCCCCCTGAGTCTGAGCCCTGCAT  1480

Query 1481  TTCAGGTGCCTTTGGGCCCAGCTGAACAGGGCTCATCCCCACTCCTGAGCCCTGTCCTCAGTGATGCTGGCGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCAGGTGCCTTTGGGCCCAGCTGAACAGGGCTCATCCCCACTCCTGAGCCCTGTCCTCAGTGATGCTGGCGGA  1554

Query 1555  GCCGGGATGGACTGCGAGGAGCCCAGACACAAGCGCGTGCCTGCAGACGAGGCCTACTTCATAGTCAAAGAGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCGGGATGGACTGCGAGGAGCCCAGACACAAGCGCGTGCCTGCAGACGAGGCCTACTTCATAGTCAAAGAGAT  1628

Query 1629  TCTCGCTACAGAACGAACATACCTCAAGGATTTAGAAGTTATTACCGTGTGGTTCCGCAGCGCAGTGGTGAAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTCGCTACAGAACGAACATACCTCAAGGATTTAGAAGTTATTACCGTGTGGTTCCGCAGCGCAGTGGTGAAGG  1702

Query 1703  AGGACGCCATGCCTGCGACTCTGATGACGCTGCTCTTCTCCAACATCGATCCCATCTATGAGTTCCACAGAGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGACGCCATGCCTGCGACTCTGATGACGCTGCTCTTCTCCAACATCGATCCCATCTATGAGTTCCACAGAGGC  1776

Query 1777  TTCCTGCGCGAGGTGGAGCAGAGGCTGGCACTCTGGGAAGGGCCCTCCAAAGCCCACACAAAAGGCAGTCATCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCCTGCGCGAGGTGGAGCAGAGGCTGGCACTCTGGGAAGGGCCCTCCAAAGCCCACACAAAAGGCAGTCATCA  1850

Query 1851  ACGAATCGGGGACATCCTGCTCAGGAACATGCGCCAGTTAAAGG-TGTTCCAG----CTCCACGAAGGGCATGT  1919
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||..|    |.|||||          
Sbjct 1851  ACGAATCGGGGACATCCTGCTCAGGAACATGCGCCAGTTAAAGGCTGCTCATGAGTTCACCACG----------  1914

Query 1920  AGCAGGGGTCACAAAAATGGAG  1941
                                  
Sbjct 1915  ----------------------  1914