Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11425
• Subject: XM_017005419.2
• Aligned Length: 1946
• Identities: 1653
• Gaps: 283

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGATAGAAGGAACATACAGAGTCCTGCAGACTGCAGGGATGCGCTTGGGTGCCCAGACCCCTGTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGATAGAAGGAACATACAGAGTCCTGCAGACTGCAGGGATGCGCTTGGGTGCCCAGACCCCTGTGGG  74

Query   75  AGTTAGCACCCTTGAGCCTGGGCAGACTCTCTTGCCCAGAATGCAAGAGAAGCACCTGCACCTCAGAGTAAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTAGCACCCTTGAGCCTGGGCAGACTCTCTTGCCCAGAATGCAAGAGAAGCACCTGCACCTCAGAGTAAAGC  148

Query  149  TGCTGGACAACACCATGGAAATATTTGACATTGAGCCTAAATGCGATGGCCAGGTATTACTGACACAAGTGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGGACAACACCATGGAAATATTTGACATTGAGCCTAAATGCGATGGCCAGGTATTACTGACACAAGTGTGG  222

Query  223  AAGCGTTTAAACCTGGTAGAATGTGACTACTTCGGGATGGAGTTTCAAAATACTCAGTCCTACTGGATTTGGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCGTTTAAACCTGGTAGAATGTGACTACTTCGGGATGGAGTTTCAAAATACTCAGTCCTACTGGATTTGGCT  296

Query  297  TGAACCTATGAAACCCATCATTAGGCAAATACGAAGGCCAAAGAATGTGGTGCTTCGCCTAGCTGTAAAATTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAACCTATGAAACCCATCATTAGGCAAATACGAAGGCCAAAGAATGTGGTGCTTCGCCTAGCTGTAAAATTTT  370

Query  371  TTCCACCTGATCCTGGTCAGCTACAAGAAGAATATACAAGATACTTGTTTGCCTTGCAACTTAAGAGAGACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCACCTGATCCTGGTCAGCTACAAGAAGAATATACAAGATACTTGTTTGCCTTGCAACTTAAGAGAGACCTG  444

Query  445  CTGGAAGAGCGTTTGACCTGTGCTGACACCACAGCGGCCCTTCTCACGTCCCATCTCCTGCAGTCGGAAATAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAAGAGCGTTTGACCTGTGCTGACACCACAGCGGCCCTTCTCACGTCCCATCTCCTGCAGTCGGAAATAGG  518

Query  519  AGATTACGATGAAACGCTGGACCGAGAGCACCTCAAAGTGAACGAGTATTTGCCTGGCCAGCAGCACTGCCTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATTACGATGAAACGCTGGACCGAGAGCACCTCAAAGTGAACGAGTATTTGCCTGGCCAGCAGCACTGCCTTG  592

Query  593  AGAAGATACTAGAATTCCATCAGAAGCACGTGGGCCAGACACCTGCTGAGTCGGATTTCCAGGTGCTCGAAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGATACTAGAATTCCATCAGAAGCACGTGGGCCAGACACCTGCTGAGTCGGATTTCCAGGTGCTCGAAATT  666

Query  667  GCTCGAAAGTTGGAAATGTACGGCATCAGATTTCACATGGCTTCTGACAGGGAAGGAACCAAGATTCAACTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTCGAAAGTTGGAAATGTACGGCATCAGATTTCACATGGCTTCTGACAGGGAAGGAACCAAGATTCAACTGGC  740

Query  741  AGTTTCCCACATGGGTGTACTCGTGTTCCAGGGCACCACCAAAATCAACACTTTCAACTGGTCCAAGGTCCGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTTCCCACATGGGTGTACTCGTGTTCCAGGGCACCACCAAAATCAACACTTTCAACTGGTCCAAGGTCCGTA  814

Query  815  AACTAAGCTTCAAGAGGAAAAGATTTCTTATCAAACTTCATCCAGAGGTTCATGGACCTTACCAGGACACATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACTAAGCTTCAAGAGGAAAAGATTTCTTATCAAACTTCATCCAGAGGTTCATGGACCTTACCAGGACACATTA  888

Query  889  GAATTTTTGTTGGGTAGTAGAGATGAATGTAAGAACTTCTGGAAGATTTGTGTGGAGTATCACACCTTTTTTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTTTTGTTGGGTAGTAGAGATGAATGTAAGAACTTCTGGAAGATTTGTGTGGAGTATCACACCTTTTTTAG  962

Query  963  ACTTTTGGACCAACCTAAGCCAAAAGCAAAAGCCGTCTTCTTCAGCCGGGGCTCCTCCTTCAGATACAGTGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTTTTGGACCAACCTAAGCCAAAAGCAAAAGCCGTCTTCTTCAGCCGGGGCTCCTCCTTCAGATACAGTGGAA  1036

Query 1037  GAACTCAGAAACAACTAGTAGATTATTTCAAAGACAGTGGAATGAAGAGAATTCCATATGAAAGAAGGCACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAACTCAGAAACAACTAGTAGATTATTTCAAAGACAGTGGAATGAAGAGAATTCCATATGAAAGAAGGCACAGC  1110

Query 1111  AAGACCCACACGTCCGTTCGAGCTCTGACTGCAGACCTACCAAAACAGAGCATCTCATTCCCCGAGGGATTGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGACCCACACGTCCGTTCGAGCTCTGACTGCAGACCTACCAAAACAGAGCATCTCATTCCCCGAGGGATTGAG  1184

Query 1185  GACTCCTGCCTCCCCATCTTCAGCGAATGCCTTTTACTCGCTCTCTCCCTCCACTCTGGTCCCCTCTGGCCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACTCCTGCCTCCCCATCTTCAGCGAATGCCTTTTACTCGCTCTCTCCCTCCACTCTGGTCCCCTCTGGCCTGC  1258

Query 1259  CAGAGTTTAAGGACAGCAGCAGCTCCCTCACAGATCCCCAGGTTTCCTACGTCAAGAGTCCAGCTGCAGAGAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGTTTAAGGACAGCAGCAGCTCCCTCACAGATCCCCAGGTTTCCTACGTCAAGAGTCCAGCTGCAGAGAGG  1332

Query 1333  CGCAGTGGAGCAGTGGCTGGAGGCCCCGACACACCATCGGCCCAGCCCCTCGGGCCCCCCGCACTCCAGCCTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCAGTGGAGCAGTGGCTGGAGGCCCCGACACACCATCGGCCCAGCCCCTCGGGCCCCCCGCACTCCAGCCTGG  1406

Query 1407  TCCAGGCCTTTCCACGAAGAGTCCTCAGCCTTCTCCCTCCAGCCGGAAGAGCCCCCTGAGTCTGAGCCCTGCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCAGGCCTTTCCACGAAGAGTCCTCAGCCTTCTCCCTCCAGCCGGAAGAGCCCCCTGAGTCTGAGCCCTGCAT  1480

Query 1481  TTCAGGTGCCTTTGGGCCCAGCTGAACAGGGCTCATCCCCACTCCTGAGCCCTGTCCTCAGTGATGCTGGCGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCAGGTGCCTTTGGGCCCAGCTGAACAGGGCTCATCCCCACTCCTGAGCCCTGTCCTCAGTGATGCTGGCGGA  1554

Query 1555  GCCGGGATGGACTGCGAGGAGCCCAGACACAAGCGCGTGCCTGCAGA----CGAGGCCTACTTCATAGTCAAAG  1624
            |||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    .||||        ||.|      
Sbjct 1555  GCCGGGATGGACTGCGAGGAGCCCAGACACAAG-----------AGATTTGTGAGG--------ATCG------  1603

Query 1625  AGATTCTCGCTACAGAACGAACATACCTCAAGGATTTA-GAAGTTATTACCGTGTGGTTCCGCAGCGCAGTGGT  1697
                    ||.|||| .|||         ||||   || |||                     ||| ||     
Sbjct 1604  --------GCCACAG-TCGA---------AAGG---TAGGAA---------------------AGC-CA-----  1629

Query 1698  GAAGGAGGACGCCATGCCTGCGACTCTGATGACGCTGCTCTTCTCCAACATCGATCCCATCTATGAGTTCCACA  1771
             ||||.||    ||                ||.||  ||||  ||||    ||.||   |..|||.|   ||||
Sbjct 1630  -AAGGTGG----CA----------------GAAGC--CTCT--TCCA----CGCTC---TGCATGGG---CACA  1668

Query 1772  GAGGCTTCCTGCGCGAGGTGGAGCAGAGGCTGGCACTCTGGGAAGGGCCCTCCAAAGCCCACACAAAAGGCAGT  1845
                                                                                      
Sbjct 1669  --------------------------------------------------------------------------  1668

Query 1846  CATCAACGAATCGGGGACATCCTGCTCAGGAACATGCGCCAGTTAAAGGTGTTCCAGCTCCACGAAGGGCATGT  1919
                                                                                      
Sbjct 1669  --------------------------------------------------------------------------  1668

Query 1920  AGCAGGGGTCACAAAAATGGAG  1941
                                  
Sbjct 1669  ----------------------  1668