Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11427
• Subject: XM_011545409.1
• Aligned Length: 2157
• Identities: 1545
• Gaps: 612

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAAAACTTCAAGCCAAACATCAAGCAGAATGTGATTTGCTTGAAGATATGAGGACATTCAGTCAGAAGAA  74

Query    1  -------------------------------ATGCAGAAGTTGGCTAGTCAATACCTGAAGAGAGATTGGCCTG  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGCTATTGAAAGAGAGTATGCACAGGGTATGCAGAAGTTGGCTAGTCAATACCTGAAGAGAGATTGGCCTG  148

Query   44  GAGTAAAAGCTGATGATCGGAATGATTACAGGAGCATGTATCCCGTTTGGAAATCTTTTCTCGAGGGAACAATG  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGTAAAAGCTGATGATCGGAATGATTACAGGAGCATGTATCCCGTTTGGAAATCTTTTCTCGAGGGAACAATG  222

Query  118  CAGGTAGCCCAGTCTCGGATGAATATATGTGAAAACTATAAAAACTTCATTTCTGAGCCTGCAAGGACAGTGAG  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGTAGCCCAGTCTCGGATGAATATATGTGAAAACTATAAAAACTTCATTTCTGAGCCTGCAAGGACAGTGAG  296

Query  192  AAGCTTAAAAGAACAGCAACTAAAAAGGTGTGTGGACCAGTTGACAAAGATCCAAACTGAATTACAAGAGACAG  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGCTTAAAAGAACAGCAACTAAAAAGGTGTGTGGACCAGTTGACAAAGATCCAAACTGAATTACAAGAGACAG  370

Query  266  TGAAAGATTTAGCTAAAGGCAAAAAGAAATACTTTGAGACTGAACAGATGGCTCATGCAGTACGAGAGAAAGCT  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAGATTTAGCTAAAGGCAAAAAGAAATACTTTGAGACTGAACAGATGGCTCATGCAGTACGAGAGAAAGCT  444

Query  340  GACATCGAGGCAAAATCTAAACTTAGTCTTTTTCAATCAAGAATCAGTTTACAGAAGGCAAGTGTAAAGTTAAA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACATCGAGGCAAAATCTAAACTTAGTCTTTTTCAATCAAGAATCAGTTTACAGAAGGCAAGTGTAAAGTTAAA  518

Query  414  AGCCCGGCGATCTGAGTGTAATTCCAAAGCTACCCACGCAAGGAATGATTATCTTCTTACCCTAGCGGCAGCAA  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCGGCGATCTGAGTGTAATTCCAAAGCTACCCACGCAAGGAATGATTATCTTCTTACCCTAGCGGCAGCAA  592

Query  488  ATGCACATCAGGATCGCTACTATCAAACAGATTTAGTTAACATTATGAAGGCTCTTGATGGAAATGTGTATGAT  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCACATCAGGATCGCTACTATCAAACAGATTTAGTTAACATTATGAAGGCTCTTGATGGAAATGTGTATGAT  666

Query  562  CATCTCAAGGATTATTTAATAGCCTTCAGCCGGACTGAGCTAGAAACATGCCAAGCTGTGCAGAACACATTCCA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCTCAAGGATTATTTAATAGCCTTCAGCCGGACTGAGCTAGAAACATGCCAAGCTGTGCAGAACACATTCCA  740

Query  636  GTTTTTATTAGAAAACTCCAGCAAGGTGGTCCGGGACTACAATCTTCAGCTGTTTTTGCAAGAAAACGCTGTAT  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTTTTATTAGAAAACTCCAGCAAGGTGGTCCGGGACTACAATCTTCAGCTGTTTTTGCAAGAAAACGCTGTAT  814

Query  710  TTCACAAACCCCAGCCCTTCCAGTTCCAGCCTTGTGACAGTGATACTAGCCGACAGTTAGAATCAGAAACTGGG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCACAAACCCCAGCCCTTCCAGTTCCAGCCTTGTGACAGTGATACTAGCCGACAGTTAGAATCAGAAACTGGG  888

Query  784  ACCACAGAGGAGCACAGTCTAAATAAGGAAGCTCGAAAATGGGCCACACGTGTGGCACGTGAGCATAAAAACAT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCACAGAGGAGCACAGTCTAAATAAGGAAGCTCGAAAATGGGCCACACGTGTGGCACGTGAGCATAAAAACAT  962

Query  858  TGTTCACCAACAACGGGTTCTAAATGATCTGGAGTGTCATGGAGCTGCTGTATCAGAACAAAGCCGAGCAGAGC  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTTCACCAACAACGGGTTCTAAATGATCTGGAGTGTCATGGAGCTGCTGTATCAGAACAAAGCCGAGCAGAGC  1036

Query  932  TAGAACAGAAAATAGATGAAGCTAGAGAAAATATTCGTAAAGCAGAGATAATTAAATTGAAAGCTGAAGCCCGG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAACAGAAAATAGATGAAGCTAGAGAAAATATTCGTAAAGCAGAGATAATTAAATTGAAAGCTGAAGCCCGG  1110

Query 1006  TTGGACCTGCTAAAGCAGATTGGTGTTTCTGTGGACACATGGCTAAAGAGTGCCATGAACCAAGTAATGGAAGA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGACCTGCTAAAGCAGATTGGTGTTTCTGTGGACACATGGCTAAAGAGTGCCATGAACCAAGTAATGGAAGA  1184

Query 1080  ACTGGAAAATGAGCGATGGGCCCGCCCTCCTGCAGTGACCAGTAATGGCACTTTACACTCGCTTAATGCAGATA  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTGGAAAATGAGCGATGGGCCCGCCCTCCTGCAGTGACCAGTAATGGCACTTTACACTCGCTTAATGCAGATA  1258

Query 1154  CCGAAAGAGAAGAAGGCGAAGAGTTTGAAGATAACATGGATGTTTTCGATGACAGCAGTTCCAGCCCTTCTGGC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGAAAGAGAAGAAGGCGAAGAGTTTGAAGATAACATGGATGTTTTCGATGACAGCAGTTCCAGCCCTTCTGGC  1332

Query 1228  ACCTTAAGAAATTATCCACTCACCTGCAAAGTTGTTTATTCCTACAAGGCTTCTCAACCAGATGAGTTGACCAT  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCTTAAGAAATTATCCACTCACCTGCAAAGTTGTTTATTCCTACAAGGCTTCTCAACCAGATGAGTTGACCAT  1406

Query 1302  TGAGGAACATGAGGTGTTAGAAGTGATTGAAGATGGAGATATGGAAGACTGGGTAAAGGCTCGAAATAAAGTTG  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGGAACATGAGGTGTTAGAAGTGATTGAAGATGGAGATATGGAAGACTGGGTAAAGGCTCGAAATAAAGTTG  1480

Query 1376  GCCAAGTGGGTTATGTGCCAGAAAAGTACCTACAGTTTCCCACCTCGAACAGCCTCCTGAGCATGCTGCAGTCC  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCAAGTGGGTTATGTGCCAGAAAAGTACCTACAGTTTCCCACCTCGAACAGCCTCCTGAGCATGCTGCAGTCC  1554

Query 1450  CTGGCCGCTTTGGACAGTCGGTCACACACGTCCAGCAATTCCACGGAAGCAGAACTCGTTTCAGGCAGCCTCAA  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGCCGCTTTGGACAGTCGGTCACACACGTCCAGCAATTCCACGGAAGCAGAACTCGTTTCAGGCAGCCTCAA  1628

Query 1524  CGGAGATGCCAGTG---GT------AAAG-AC------------------------------------------  1545
            ||||||||||||||   ||      |||| ||                                          
Sbjct 1629  CGGAGATGCCAGTGTATGTTTTGTGAAAGCACTTTATGATTATGAGGGCCAGACAGATGATGAGTTATCTTTTC  1702

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 1703  CTGAGGGAGCAATAATCCGTATCTTGAACAAAGAAAACCAAGATGATGATGGCTTCTGGGAAGGGGAATTCAAT  1776

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 1777  GGGCGTATTGGAGTTTTCCCATCGGTGCTAGTGGAAGAACTTTCAGCCTCAGAAAATGGTGACACTCCATGGAT  1850

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 1851  GAGAGAGATTCAGATCTCTCCTTCCCCCAAGCCACACGCCTCCCTGCCTCCACTGCCGTTGTACGACCAGCCTC  1924

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 1925  CCAGCAGCCCCTACCCCAGCCCAGATAAGAGGAGCTCCCTGTACTTTCCCCGGTCTCCTTCAGCAAACGAAAAA  1998

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 1999  AGCCTTCATGCTGAGTCACCAGGATTCTCACAGGCATCAAGGCATACTCCTGAGACCTCATATGGCAAACTGCG  2072

Query 1546  --------------------------------------------------------------------------  1545
                                                                                      
Sbjct 2073  ACCTGTCCGGGCAGCTCCCCCTCCACCTACACAGAATCACCGAAGGCCAGCAGAGAAGATTGAAGATGTGGAAA  2146

Query 1546  -----------  1545
                       
Sbjct 2147  TCACACTGGTG  2157