Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11428
• Subject: XM_006510899.4
• Aligned Length: 2635
• Identities: 1602
• Gaps: 866

Alignment

Query    1  ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74

Query   75  GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148

Query  149  ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG  222

Query  223  GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC  296
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC  296

Query  297  TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA  370

Query  371  TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG  444
            ||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG  444

Query  445  AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG  518

Query  519  ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA  592
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA  592

Query  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT  666

Query  667  TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT  740
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct  667  TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT  740

Query  741  GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA  772
            |||||||||.||||||||.|                                          ||.|||||||||
Sbjct  741  GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA  814

Query  773  GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAA------ATCT  840
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||      ||||
Sbjct  815  GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAATGAAGGATCT  888

Query  841  GGTGCTCCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  914
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCTCCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  962

Query  915  TATTGACACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCAT  988
            |||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.||||
Sbjct  963  TATCGACACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCAT  1036

Query  989  CTAGTGATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------  1041
            |.||.||||||||.||.||.|||||.|||||   |||||||         ||||||||||||            
Sbjct 1037  CAAGCGATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCT  1107

Query 1042  ---------------------------------------------------GCCGCA-----------------  1047
                                                               ||.|||                 
Sbjct 1108  CCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGACCTTTTGGGAGAGGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTG  1181

Query 1048  -------------------------GCACCAG------------------------------------------  1054
                                     |||||||                                          
Sbjct 1182  TGAAGCACCGATTTCAGACCCATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCT  1255

Query 1055  ----------CACCAC----------------------------------------------------------  1060
                      ||||||                                                          
Sbjct 1256  CTGCCTCGACCACCACAGCTGTGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCT  1329

Query 1061  -------------------------------------CACCACCT-----------------------------  1068
                                                 |||||.||                             
Sbjct 1330  CCTGGGGAGGCCCCTGCAGCATCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGA  1403

Query 1069  ------------------------------------------------------------GCTGGA--------  1074
                                                                        ||||||        
Sbjct 1404  TGCATGCTCAGGAAATGACCCTTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTG  1477

Query 1075  --------------------------------------------------------------------------  1074
                                                                                      
Sbjct 1478  CAATGAAGCCACCTGAGACCAGCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACT  1551

Query 1075  ---------------------------GGAGCCACTGC------------------------------------  1085
                                       |.|||||||||                                    
Sbjct 1552  GCTCCTTCTCCTGCTCCCACGGCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCAC  1625

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1626  TGCCACCACCTCTGCTGCTGCTGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTG  1699

Query 1086  ---------------------------------------------------------------------ATG--  1088
                                                                                 |||  
Sbjct 1700  ATTCTGCTCCTGAAGTTGCTGCAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCT  1773

Query 1089  --------------------------------------------------------------------------  1088
                                                                                      
Sbjct 1774  TTCTCCTCCCCGCCACGAGGGGCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGTGGACGC  1847

Query 1089  -------------------------------------------------------------------------G  1089
                                                                                     |
Sbjct 1848  ATTTGCAGCGCCGTCTCCTGCATCCACTGCCTCTCCTGCAAAGGCGGAGTCCTCGGGTGTCATAGACCTTTTTG  1921

Query 1090  GGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCC  1163
            || |||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1922  GG-GGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACC  1994

Query 1164  CAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATG  1237
            ||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1995  CAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATG  2068

Query 1238  GTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGT  1311
            ||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2069  GTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGT  2142

Query 1312  CCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGG  1385
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2143  CCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGG  2216

Query 1386  AATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCA  1459
            .|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2217  GATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCA  2290

Query 1460  ACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTA  1533
            |||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.||            ||||||..||||.
Sbjct 2291  ACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTT  2352

Query 1534  CCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCC  1607
            ||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353  CCACCAACCAGCTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCC  2426

Query 1608  TCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCT  1681
            ||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2427  TCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCT  2500

Query 1682  TTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCT  1755
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2501  TTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCT  2574

Query 1756  CCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC---------------  1785
            |||||.||||||||.|||||||||||||||               
Sbjct 2575  CCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG  2619