Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11428
• Subject: XM_006510902.4
• Aligned Length: 2550
• Identities: 1601
• Gaps: 780

Alignment

Query    1  ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74

Query   75  GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148

Query  149  ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG  222

Query  223  GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC  296
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC  296

Query  297  TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA  370

Query  371  TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG  444
            ||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG  444

Query  445  AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG  518

Query  519  ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA  592
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA  592

Query  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT  666

Query  667  TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT  740
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct  667  TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT  740

Query  741  GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA  772
            |||||||||.||||||||.|                                          ||.|||||||||
Sbjct  741  GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA  814

Query  773  GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAA------ATCT  840
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||      ||||
Sbjct  815  GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAATGAAGGATCT  888

Query  841  GGTGCTCCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  914
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCTCCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  962

Query  915  TATTGACACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCAT  988
            |||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.||||
Sbjct  963  TATCGACACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCAT  1036

Query  989  CTAGTGATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------  1041
            |.||.||||||||.||.||.|||||.|||||   |||||||         ||||||||||||            
Sbjct 1037  CAAGCGATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCT  1107

Query 1042  ---------------------------------------------------GCCGCA-----------------  1047
                                                               ||.|||                 
Sbjct 1108  CCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGACCTTTTGGGAGAGGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTG  1181

Query 1048  -------------------------GCACCAG------------------------------------------  1054
                                     |||||||                                          
Sbjct 1182  TGAAGCACCGATTTCAGACCCATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCT  1255

Query 1055  ----------CACCAC----------------------------------------------------------  1060
                      ||||||                                                          
Sbjct 1256  CTGCCTCGACCACCACAGCTGTGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCT  1329

Query 1061  -------------------------------------CACCACCT-----------------------------  1068
                                                 |||||.||                             
Sbjct 1330  CCTGGGGAGGCCCCTGCAGCATCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGA  1403

Query 1069  ------------------------------------------------------------GCTGGA--------  1074
                                                                        ||||||        
Sbjct 1404  TGCATGCTCAGGAAATGACCCTTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTG  1477

Query 1075  --------------------------------------------------------------------------  1074
                                                                                      
Sbjct 1478  CAATGAAGCCACCTGAGACCAGCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACT  1551

Query 1075  ---------------------------GGAGCCACTGC------------------------------------  1085
                                       |.|||||||||                                    
Sbjct 1552  GCTCCTTCTCCTGCTCCCACGGCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCAC  1625

Query 1086  -----------------------------------------------------------ATGGGGA--------  1092
                                                                       .|||.||        
Sbjct 1626  TGCCACCACCTCTGCTGCTGCTGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTG  1699

Query 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092
                                                                                      
Sbjct 1700  ATTCTGCTCCTGAAGTTGCTGCAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCT  1773

Query 1093  ------------------------------------------------------------------GGATTTGG  1100
                                                                              ||||||||
Sbjct 1774  TTCTCCTCCCCGCCACGAGGGGCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGGATTTGG  1847

Query 1101  GGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGG  1174
            |||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||
Sbjct 1848  GGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGG  1921

Query 1175  CAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGAT  1248
            ||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1922  CAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGAT  1995

Query 1249  CTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGC  1322
            |||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGC  2069

Query 1323  AGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTA  1396
            |||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2070  AGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTA  2143

Query 1397  CCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCT  1470
            |||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2144  CCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCG  2217

Query 1471  AAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAG  1544
            |||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.||            ||||||..||||.||.||||||||
Sbjct 2218  AAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAG  2279

Query 1545  TTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGA  1618
            .|||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 2280  CTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGA  2353

Query 1619  CAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCC  1692
            ||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2354  CAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCA  2427

Query 1693  GCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGA  1766
            |||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2428  GCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGA  2501

Query 1767  CCCATTAGCGGATCTTAAC---------------  1785
            |||.|||||||||||||||               
Sbjct 2502  CCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG  2535