Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11432
- Subject:
- NM_014862.4
- Aligned Length:
- 2181
- Identities:
- 2111
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
Query 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
Query 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
Query 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
Query 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
Query 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
Query 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
Query 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
Query 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
Query 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
Query 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
Query 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
Query 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
Query 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
Query 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCCCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
Query 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
Query 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
Query 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
Query 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
Query 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
Query 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
Query 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCTCTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCTCTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTCA 1628
Query 1629 TGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTAA 1702
Query 1703 ACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAAG 1776
Query 1777 ACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCTC 1850
Query 1851 CAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAAA 1924
Query 1925 GTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGGC 1998
Query 1999 CAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGCC 2072
Query 2073 AGGAGATCCA------GGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACTCCCGGCAGCACTTTAGGCAGCCCAT--AAG-CT 2137
|||||||||| |||| |.|||| |||.|| .||| ||| ||
Sbjct 2073 AGGAGATCCAACCCAGGGGA----------------------CTGGCA--ACTATA------ACATCGAAGACT 2116
Query 2138 ATGC------GAGAATG------------------ 2148
.||| |.|.|||
Sbjct 2117 TTGCCGACCTGGGCATGTTTCCACCGTTTTCTGAG 2151