Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11432
- Subject:
- XM_006507238.3
- Aligned Length:
- 2190
- Identities:
- 1857
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATG------------GCAACCCCG-GCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGA 61
||| ||||..|.| |.| |.||.|||||.|||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1 ATGTTTCTGACCTGTGCAAAACTGAGAG-------------CAGAGATGGCGTCAGACATACCAGGATCTGTGG 61
Query 62 CGTTGCCCGTTGCCCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAG 135
|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 62 CCTTGCCTGTTGCCCCCATGGCAGCCACCGGACAGGTGAGAATGGCAGGGGCCATGCCTGCCCGAGGAGGAAAG 135
Query 136 CGGCGTTCCGGAATGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGA 209
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 136 CGTCGATCCGGAATGGACTTCGATGACGAAGATGGTGAAGGTCCCAGTAAATTCTCAAGAGAGAACCACAGTGA 209
Query 210 AATCGAAAGGCGCAGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCG 283
.||.||..|||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 210 GATTGAGCGGCGCAGGCGGAACAAGATGACTCAATATATTACGGAACTCTCCGACATGGTTCCCACCTGCAGTG 283
Query 284 CACTGGCTCGGAAGCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACA 357
||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 284 CACTGGCTAGGAAGCCAGACAAGCTGACCATCCTGCGCATGGCGGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGCACC 357
Query 358 GGGAACAAGTCCACCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGA 431
||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 358 GGCAACAAATCGACTGACGGCGCCTACAAGCCTTCCTTCCTCACTGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTGGA 431
Query 432 AGCAGCTGATGGATTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCC 505
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 432 AGCCGCTGATGGATTTCTGTTTGTGGTGGCAGCTGAGACAGGGAGAGTCATCTACGTGTCTGATTCGGTCACTC 505
Query 506 CTGTTCTGAACCAGCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAG 579
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 506 CTGTCCTGAACCAGCCACAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACGCTTTATGAGCAGGTGCACCCTGATGACGTGGAG 579
Query 580 AAGCTGAGAGAGCAACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGT 653
||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 580 AAACTGAGGGAACAGCTGTGCACTTCGGAAAACTCCATGACAGGCCGCATCCTGGACCTGAAGACTGGGACAGT 653
Query 654 CAAGAAAGAAGGGCAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGT 727
.|||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 654 GAAGAAGGAGGGACAGCAGTCATCCATGCGCATGTGTATGGGCTCTCGGCGCTCCTTCATCTGTAGGATGAGGT 727
Query 728 GTGGAAATGCTCCTTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTT 801
|||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 GTGGAAACGCTCCCTTGGACCACCTGCCTTTGAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTT 801
Query 802 GGCCCTGTGAAAGAAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGC 875
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 802 GGCCCTGTGAAAGAAGGAGAAGCCCAGTATGCTGTGGTCCACTGCACAGGTTACATCAAGGCTTGGCCACCAGC 875
Query 876 AGGAATGACCATACCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGAC 949
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 876 AGGAATGACCATACCCGAAGAAGACGCTGATGTCGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGGC 949
Query 950 TCCAGGTGACCAGCTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCAT 1023
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||.
Sbjct 950 TCCAGGTGACCAGCTCTCCTGTGTGCATGGACATGAGCGGCATGTCAGTGCCCACAGAGTTCCTGTCACGGCAC 1023
Query 1024 AACTCCGATGGAATCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCT 1097
|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1024 AACTCTGATGGGATTATCACGTTTGTGGACCCCAGATGCATCAGTGTGATTGGCTACCAGCCCCAGGACCTTCT 1097
Query 1098 GGGAAAGGACATTTTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTA 1171
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1098 GGGAAAGGATATTTTGGAATTTTGCCACCCTGAGGATCAGAGCCACCTACGGGAGAGCTTCCAACAGGTGGTTA 1171
Query 1172 AGCTGAAAGGCCAAGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACC 1245
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 1172 AGCTGAAGGGCCAAGTGCTGTCGGTCATGTATCGGTTCCGCACCAAGAACCGGGAGTGGCTGTTGATCCGTACC 1245
Query 1246 AGCAGCTTCACATTCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCA 1319
|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1246 AGCAGCTTCACCTTCCAGAACCCCTACTCTGATGAGATCGAGTACGTCATCTGCACCAACACCAATGTCAAGCA 1319
Query 1320 ACTTCAGCAACAGCAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCC 1393
||||||||||||||||||||||.||||.||.||.|||.|||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1320 ACTTCAGCAACAGCAGGCAGAACTGGAGGTACATCAGCGAGATGGGCTGTCGTCATATGACTTATCTCAGGTCC 1393
Query 1394 CCGTCCCCAACCTACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAG 1467
|.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1394 CAGTACCCAACCTACCCGCTGGTGTTCACGAGGCCGGGAAGTCTGTGGAAAAGGCAGATGCAATCTTCTCCCAA 1467
Query 1468 GAAAGAGATCCTCGGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTC 1541
||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GAGAGAGACCCTCGTTTTGCTGAGATGTTTGCAGGCATCAGTGCATCTGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTC 1541
Query 1542 TGCAGCAGGAACCCAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCT-CTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGC 1614
.|||.||||.|.||||||||||||||||||||||||.||| |||||| |.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1542 AGCATCAGGCAGCCAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGTCCA-TTCCCTGCCGGGCACTCGGGCAAGGCCTTCAGC 1614
Query 1615 TCTTCAGTGGTTCATGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAAT 1688
|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1615 TCTTCCGTGGTCCATGTGCCTGGAGTGAATGACATTCAGTCCTCCTCCTCAACGGGACAGAACATATCCCAGAT 1688
Query 1689 CTCCCGGCAGCTAAACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCAT 1762
|||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1689 CTCTCGGCAGCTGAACCAGGGCCAGGTGGCATGGACAGGCAGCCGTCCACCGTTCCCAGGGCAGC--------- 1753
Query 1763 CTCAGTCCAGCAAGACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCC 1836
||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1754 ------CCAGCAAGACGCAGTCATCTGCCTTCGGAATTGGATCAAGCCACCCTTACCCGGCTGACCCTTCATCC 1821
Query 1837 TACAGCCCCCTCTCCAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCC 1910
|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 TACAGTCCTCTCTCCAGCCCAGCTGCCTCCTCACCAAGTGGAAACGCATACCCCAGTCTTGCCAACAGGACTCC 1895
Query 1911 AGGGTTCGCTGAAAGTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAA 1984
||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1896 AGGGTTTGCTGAGAGTGGACAGAGTGGCGGGCAGTTCCAGGGCCGGCCCTCGGAGGTCTGGTCCCAGTGGCAGA 1969
Query 1985 GCCAGCACCATGGCCAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGAC 2058
|||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 GCCAGCATCACGGACAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCGCATCAGCAGCCTGGCCAGACTGAAGTGTTCCAGGAC 2043
Query 2059 ATGCTGCCCATGCCAGGAGATC-----CAGGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACT-----CCCGGCAGCACTTTA 2122
|||||.||||||||.||.||.| ||||| ||.||| |.||| ..|| ||.|||||
Sbjct 2044 ATGCTACCCATGCCGGGCGACCCGACGCAGGG---GACTGG--------CAACTATAACATCG--AGGACTTT- 2103
Query 2123 GGCAGCCCATAAGCTATGCGAGAATG------------------ 2148
||.|.|| .|.|.|||
Sbjct 2104 -GCTGACC----------TGGGCATGTTCCCTCCATTTTCTGAG 2136