Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11432
- Subject:
- XM_006507243.1
- Aligned Length:
- 2177
- Identities:
- 1833
- Gaps:
- 115
Alignment
Query 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGGCGTCAGACATACCAGGATCTGTGGCCTTGCCTGTTGC 41
Query 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 42 CCCCATGGCAGCCACCGGACAGGTGAGAATGGCAGGGGCCATGCCTGCCCGAGGAGGAAAGCGTCGATCCGGAA 115
Query 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||| |||||.||.||..|||||
Sbjct 116 TGGACTTCGATGACGAAGATGGTGAAGGTCCCAGTAAATTCTCA------------AGTGAGATTGAGCGGCGC 177
Query 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct 178 AGGCGGAACAAGATGACTCAATATATTACGGAACTCTCCGACATGGTTCCCACCTGCAGTGCACTGGCTAGGAA 251
Query 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 252 GCCAGACAAGCTGACCATCCTGCGCATGGCGGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGCACCGGCAACAAATCGA 325
Query 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 326 CTGACGGCGCCTACAAGCCTTCCTTCCTCACTGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTGGAAGCCGCTGATGGA 399
Query 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 400 TTTCTGTTTGTGGTGGCAGCTGAGACAGGGAGAGTCATCTACGTGTCTGATTCGGTCACTCCTGTCCTGAACCA 473
Query 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 474 GCCACAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACGCTTTATGAGCAGGTGCACCCTGATGACGTGGAGAAACTGAGGGAAC 547
Query 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 548 AGCTGTGCACTTCGGAAAACTCCATGACAGGCCGCATCCTGGACCTGAAGACTGGGACAGTGAAGAAGGAGGGA 621
Query 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 622 CAGCAGTCATCCATGCGCATGTGTATGGGCTCTCGGCGCTCCTTCATCTGTAGGATGAGGTGTGGAAACGCTCC 695
Query 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 CTTGGACCACCTGCCTTTGAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 769
Query 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 AAGGAGAAGCCCAGTATGCTGTGGTCCACTGCACAGGTTACATCAAGGCTTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 843
Query 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 844 CCCGAAGAAGACGCTGATGTCGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGGCTCCAGGTGACCAG 917
Query 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
|||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 918 CTCTCCTGTGTGCATGGACATGAGCGGCATGTCAGTGCCCACAGAGTTCCTGTCACGGCACAACTCTGATGGGA 991
Query 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 992 TTATCACGTTTGTGGACCCCAGATGCATCAGTGTGATTGGCTACCAGCCCCAGGACCTTCTGGGAAAGGATATT 1065
Query 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1066 TTGGAATTTTGCCACCCTGAGGATCAGAGCCACCTACGGGAGAGCTTCCAACAGGTGGTTAAGCTGAAGGGCCA 1139
Query 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1140 AGTGCTGTCGGTCATGTATCGGTTCCGCACCAAGAACCGGGAGTGGCTGTTGATCCGTACCAGCAGCTTCACCT 1213
Query 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
|||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 TCCAGAACCCCTACTCTGATGAGATCGAGTACGTCATCTGCACCAACACCAATGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1287
Query 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
|||||||||.||||.||.||.|||.|||||||..||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1288 CAGGCAGAACTGGAGGTACATCAGCGAGATGGGCTGTCGTCATATGACTTATCTCAGGTCCCAGTACCCAACCT 1361
Query 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
|||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1362 ACCCGCTGGTGTTCACGAGGCCGGGAAGTCTGTGGAAAAGGCAGATGCAATCTTCTCCCAAGAGAGAGACCCTC 1435
Query 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
|.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.|
Sbjct 1436 GTTTTGCTGAGATGTTTGCAGGCATCAGTGCATCTGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCAGCATCAGGCAGC 1509
Query 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCT-CTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTC 1627
|||||||||||||||||||||||.||| |||||| |.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1510 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGTCCA-TTCCCTGCCGGGCACTCGGGCAAGGCCTTCAGCTCTTCCGTGGTCC 1582
Query 1628 ATGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTA 1701
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1583 ATGTGCCTGGAGTGAATGACATTCAGTCCTCCTCCTCAACGGGACAGAACATATCCCAGATCTCTCGGCAGCTG 1656
Query 1702 AACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAA 1775
||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||| |||||||
Sbjct 1657 AACCAGGGCCAGGTGGCATGGACAGGCAGCCGTCCACCGTTCCCAGGGCAGC---------------CCAGCAA 1715
Query 1776 GACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCT 1849
|||.|||||||||.||||.||.||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1716 GACGCAGTCATCTGCCTTCGGAATTGGATCAAGCCACCCTTACCCGGCTGACCCTTCATCCTACAGTCCTCTCT 1789
Query 1850 CCAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAA 1923
|||||||||||.|||||||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1790 CCAGCCCAGCTGCCTCCTCACCAAGTGGAAACGCATACCCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTTGCTGAG 1863
Query 1924 AGTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGG 1997
||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1864 AGTGGACAGAGTGGCGGGCAGTTCCAGGGCCGGCCCTCGGAGGTCTGGTCCCAGTGGCAGAGCCAGCATCACGG 1937
Query 1998 CCAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGC 2071
.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1938 ACAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCGCATCAGCAGCCTGGCCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTACCCATGC 2011
Query 2072 CAGGAGATC-----CAGGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACT-----CCCGGCAGCACTTTAGGCAGCCCATAAG 2135
|.||.||.| ||||| ||.||| |.||| ..|| ||.||||| ||.|.||
Sbjct 2012 CGGGCGACCCGACGCAGGG---GACTGG--------CAACTATAACATCG--AGGACTTT--GCTGACC----- 2065
Query 2136 CTATGCGAGAATG------------------ 2148
.|.|.|||
Sbjct 2066 -----TGGGCATGTTCCCTCCATTTTCTGAG 2091