Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11432
- Subject:
- XM_006507244.3
- Aligned Length:
- 2149
- Identities:
- 1841
- Gaps:
- 83
Alignment
Query 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCAACCCCGGCCGCCGTCAACCCTCCGGAGATGGCGTCAGACATACCAGGATCTGTGGCCTTGCCTGTTGC 74
Query 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 CCCCATGGCAGCCACCGGACAGGTGAGAATGGCAGGGGCCATGCCTGCCCGAGGAGGAAAGCGTCGATCCGGAA 148
Query 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||..|||||
Sbjct 149 TGGACTTCGATGACGAAGATGGTGAAGGTCCCAGTAAATTCTCAAGAGAGAACCACAGTGAGATTGAGCGGCGC 222
Query 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct 223 AGGCGGAACAAGATGACTCAATATATTACGGAACTCTCCGACATGGTTCCCACCTGCAGTGCACTGGCTAGGAA 296
Query 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 297 GCCAGACAAGCTGACCATCCTGCGCATGGCGGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGCACCGGCAACAAATCGA 370
Query 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 CTGACGGCGCCTACAAGCCTTCCTTCCTCACTGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTGGAAGCCGCTGATGGA 444
Query 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCAGCTGAGACAGGGAGAGTCATCTACGTGTCTGATTCGGTCACTCCTGTCCTGAACCA 518
Query 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 519 GCCACAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACGCTTTATGAGCAGGTGCACCCTGATGACGTGGAGAAACTGAGGGAAC 592
Query 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 593 AGCTGTGCACTTCGGAAAACTCCATGACAGGCCGCATCCTGGACCTGAAGACTGGGACAGTGAAGAAGGAGGGA 666
Query 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 CAGCAGTCATCCATGCGCATGTGTATGGGCTCTCGGCGCTCCTTCATCTGTAGGATGAGGTGTGGAAACGCTCC 740
Query 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTGGACCACCTGCCTTTGAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
Query 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGGAGAAGCCCAGTATGCTGTGGTCCACTGCACAGGTTACATCAAGGCTTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
Query 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 CCCGAAGAAGACGCTGATGTCGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGGCTCCAGGTGACCAG 962
Query 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
|||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 963 CTCTCCTGTGTGCATGGACATGAGCGGCATGTCAGTGCCCACAGAGTTCCTGTCACGGCACAACTCTGATGGGA 1036
Query 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 TTATCACGTTTGTGGACCCCAGATGCATCAGTGTGATTGGCTACCAGCCCCAGGACCTTCTGGGAAAGGATATT 1110
Query 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 TTGGAATTTTGCCACCCTGAGGATCAGAGCCACCTACGGGAGAGCTTCCAACAGGTGGTTAAGCTGAAGGGCCA 1184
Query 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185 AGTGCTGTCGGTCATGTATCGGTTCCGCACCAAGAACCGGGAGTGGCTGTTGATCCGTACCAGCAGCTTCACCT 1258
Query 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
|||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAACCCCTACTCTGATGAGATCGAGTACGTCATCTGCACCAACACCAATGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
Query 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
|||||||||.||||.||.||.|||.|||||||..||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1333 CAGGCAGAACTGGAGGTACATCAGCGAGATGGGCTGTCGTCATATGACTTATCTCAGGTCCCAGTACCCAACCT 1406
Query 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
|||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1407 ACCCGCTGGTGTTCACGAGGCCGGGAAGTCTGTGGAAAAGGCAGATGCAATCTTCTCCCAAGAGAGAGACCCTC 1480
Query 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
|.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.|
Sbjct 1481 GTTTTGCTGAGATGTTTGCAGGCATCAGTGCATCTGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCAGCATCAGGCAGC 1554
Query 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCT-CTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTC 1627
|||||||||||||||||||||||.||| |||||| |.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGTCCA-TTCCCTGCCGGGCACTCGGGCAAGGCCTTCAGCTCTTCCGTGGTCC 1627
Query 1628 ATGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTA 1701
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1628 ATGTGCCTGGAGTGAATGACATTCAGTCCTCCTCCTCAACGGGACAGAACATATCCCAGATCTCTCGGCAGCTG 1701
Query 1702 AACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAA 1775
||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||| |||||||
Sbjct 1702 AACCAGGGCCAGGTGGCATGGACAGGCAGCCGTCCACCGTTCCCAGGGCAGC---------------CCAGCAA 1760
Query 1776 GACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCT 1849
|||.|||||||||.||||.||.||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1761 GACGCAGTCATCTGCCTTCGGAATTGGATCAAGCCACCCTTACCCGGCTGACCCTTCATCCTACAGTCCTCTCT 1834
Query 1850 CCAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAA 1923
|||||||||||.|||||||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1835 CCAGCCCAGCTGCCTCCTCACCAAGTGGAAACGCATACCCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTTGCTGAG 1908
Query 1924 AGTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGG 1997
||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1909 AGTGGACAGAGTGGCGGGCAGTTCCAGGGCCGGCCCTCGGAGGTCTGGTCCCAGTGGCAGAGCCAGCATCACGG 1982
Query 1998 CCAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGC 2071
.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1983 ACAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCGCATCAGCAGCCTGGCCAGACTGAAGTGTTCCAG---------------- 2040
Query 2072 CAGGAGATCCAGGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACTCCCGGCAGCACTTTAGGCAGCCCATAAGCTATGCGAGA 2145
|.|.||||||.|| |||||.|.|| || ||
Sbjct 2041 --GTAAATCCAGCGA-------------------------GCAGCGCCTT--------------CT---CG--- 2067
Query 2146 ATG 2148
Sbjct 2068 --- 2067