Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11448
• Subject: NM_005482.3
• Aligned Length: 1185
• Identities: 990
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCAGCCGGGCTGCGACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTTCGGCAGCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCAGCCGGGCTGCGACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTTCGGCAGCGT  74

Query   75  GGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGGCTGTTCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGGCTGTTCTGG  148

Query  149  TGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGTGTCAAGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGTGTCAAGAGG  222

Query  223  CTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAATCCCAAACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAATCCCAAACC  296

Query  297  AGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATTATAGAAGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATTATAGAAGTT  370

Query  371  ATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGGGGATCCCACCTAGTACTCCTCGGTCAAAACGT  444
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGGATCCCACCTAGTACTCCTCGGTCAAAACGT  444

Query  445  CTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTTAAAATTTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTTAAAATTTCA  518

Query  519  AGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACGCTACAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACGCTACAATG  592

Query  593  AGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAACATAATGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAACATAATGGCT  666

Query  667  CTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTATGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTATGGA  740

Query  741  TAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGAATGACCTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGAATGACCTTT  814

Query  815  TTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGGGATCCTAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGGGATCCTAAA  888

Query  889  AATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAACA  962

Query  963  GGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGGTAT--------TCATCT--------------------------------  996
            ||||||||||||||||||||||||.|||        .||..|                                
Sbjct  963  GGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGCTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAATGGAACCTCTGAAATATG  1036

Query  997  --------------------------------------------------------------------------  996
                                                                                      
Sbjct 1037  CTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACCAGAAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCTGGGGGCTTT  1110

Query  997  --------------------------------------------------------------------------  996
                                                                                      
Sbjct 1111  ATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGGAATTAAGCATATGAAGTTCATTTT  1184

Query  997  -  996
             
Sbjct 1185  T  1185