Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11448
• Subject: NM_025662.5
• Aligned Length: 1200
• Identities: 841
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCA----GCCG--GGCTGC---GACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTT  65
            |||||.|.|.||..|..|||||    ||.|  ||||.|   |.|.|.||||||         |||||||||..|
Sbjct    1  ATGGCGGCCCCCTGCTTCCTCACTCTGCGGGTGGCTACCCTGGCCGCCTTGGC---------GCTCTTGTCTCT  65

Query   66  CGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGG  139
            |||||||...||||||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct   66  CGGCAGCTCTGCCGCTGGACACATCGAGGATCAAGCCGAACAGTTCTTTAGAAGTGGACACACAAATAACTGGG  139

Query  140  CTGTTCTGGTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGT  213
            |||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  140  CTGTTTTGGTGTGCACATCCCGATTCTGGTTTAACTACCGACATGTTGCAAATACTCTTTCTGTTTATAGAAGC  213

Query  214  GTCAAGAGGCTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAA  287
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||.|.||
Sbjct  214  GTCAAGAGGCTAGGTATCCCGGACAGTCACATTGTCCTGATGCTTGCTGATGACATGGCGTGCAATGCTCGGAA  287

Query  288  TCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATT  361
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  288  CCCCAAGCCAGCCACAGTGTTCAGCCACAAGAACATGGAGCTCAATGTGTATGGAGACGATGTGGAAGTGGACT  361

Query  362  ATAGAAGTTATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGGGGATCCCACCTAGTACTCCTCGG  435
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.|||.||.|.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  362  ACAGAAGCTATGAGGTAACTGTGGAGAACTTTTTAAGGGTATTGACCGGGAGGGTTCCACCCAGTACCCCTCGC  435

Query  436  TCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTT  509
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  436  TCAAAGCGTCTTCTTTCCGACGACAGAAGCAATATCCTCATTTATATGACAGGTCATGGAGGGAATGGTTTCTT  509

Query  510  AAAATTTCAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGAC  583
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  510  GAAATTCCAAGATTCTGAAGAAATCACCAACATAGAACTTGCAGATGCGTTTGAACAGATGTGGCAGAAGAGAC  583

Query  584  GCTACAATGAGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAAC  657
            |||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  584  GCTACAATGAGCTGCTGTTCATTATTGACACTTGCCAGGGCGCGTCCATGTACGAGCGGTTCTACTCTCCTAAC  657

Query  658  ATAATGGCTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCA  731
            ||.|||||..|.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  658  ATCATGGCCTTGGCTAGTAGCCAGGTGGGAGAGGATTCGCTGTCGCACCAGCCTGACCCTGCGATTGGAGTTCA  731

Query  732  TCTTATGGATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGA  805
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  732  TCTTATGGATAGGTACACGTTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAATCCAGCTAGCCAAACTAACATGA  805

Query  806  ATGACCTTTTTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGG  879
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.
Sbjct  806  ACGACCTTTTTCAAGTGTGTCCCAAAAGTCTCTGTGTGTCGACCCCTGGACATCGCACTGACCTTTTCCAGCGA  879

Query  880  GATCCTAAAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAA  953
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||..||.|.
Sbjct  880  GATCCAAAAAATGTCCTGATCACCGATTTCTTCGGAAGTGTGCGCAAGGTGGAAATCACAACAGAGAAGATCAG  953

Query  954  ATTGCAACAGGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGGTATTCATCT-------------------------------  996
            .|||||...|||||||.||.||.||||.|||||      .|||                               
Sbjct  954  TTTGCAGTGGGATTCACAAGTCGTGGACAGCAG------TTCTAAAGAAGACGGCACGGCCGAGGAGCGCATGG  1021

Query  997  --------------------------------------------------------------------------  996
                                                                                      
Sbjct 1022  GACCTCTCAAGTATGCTGAGCAGCTCCCGGTGGCTCAGATAATACACCAGAAGCCAAAGCCGAGAGACTGGCAC  1095

Query  997  --------------------------------------------------------------------------  996
                                                                                      
Sbjct 1096  CCTCCCGGAGGCTTCATCCTGGGGCTGTGGGCGCTCATCATCATGGTCTTCTTCAAGACCTATGGGATCAAGCA  1169

Query  997  ----------------  996
                            
Sbjct 1170  TATGAAGTTCATTTTC  1185