Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11462
• Subject: NM_001166395.2
• Aligned Length: 1158
• Identities: 1110
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCCATCTTGGCTCTATTCTTCCA  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTACTGCCTAAAAAAATGAAGCTCCTGCTGTTTCTGGTTTCCCAGATGGCCATCTTGGCTCTATTCTTCCA  74

Query   27  CATGTACAGCCACAACATCAGCTCCCTGTCTATGAAGGCACAGCCCGAGCGCATGCACGTGCTGGTTCTGTCTT  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGTACAGCCACAACATCAGCTCCCTGTCTATGAAGGCACAGCCCGAGCGCATGCACGTGCTGGTTCTGTCTT  148

Query  101  CCTGGCGCTCTGGCTCTTCTTTTGTGGGGCAGCTTTTTGGGCAGCACCCAGATGTTTTCTACCTGATGGAGCCC  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCTCTGGCTCTTCTTTTGTGGGGCAGCTTTTTGGGCAGCACCCAGATGTTTTCTACCTGATGGAGCCC  222

Query  175  GCCTGGCACGTGTGGATGACCTTCAAGCAGAGCACCGCCTGGATGCTGCACATGGCTGTGCGGGATCTGATACG  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTGGCACGTGTGGATGACCTTCAAGCAGAGCACCGCCTGGATGCTGCACATGGCTGTGCGGGATCTGATACG  296

Query  249  GGCCGTCTTCTTGTGCGACATGAGCGTCTTTGATGCCTACATGGAACCTGGTCCCCGGAGACAGTCCAGCCTCT  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCGTCTTCTTGTGCGACATGAGCGTCTTTGATGCCTACATGGAACCTGGTCCCCGGAGACAGTCCAGCCTCT  370

Query  323  TTCAGTGGGAGAACAGCCGGGCCCTGTGTTCTGCACCTGCCTGTGACATCATCCCACAAGATGAAATCATCCCC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCAGTGGGAGAACAGCCGGGCCCTGTGTTCTGCACCTGCCTGTGACATCATCCCACAAGATGAAATCATCCCC  444

Query  397  CGGGCTCACTGCAGGCTCCTGTGCAGTCAACAGCCCTTTGAGGTGGTGGAGAAGGCCTGCCGCTCCTACAGCCA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGCTCACTGCAGGCTCCTGTGCAGTCAACAGCCCTTTGAGGTGGTGGAGAAGGCCTGCCGCTCCTACAGCCA  518

Query  471  CGTGGTGCTCAAGGAGGTGCGCTTCTTCAACCTGCAGTCCCTCTACCCGCTGCTGAAAGACCCCTCCCTCAACC  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGGTGCTCAAGGAGGTGCGCTTCTTCAACCTGCAGTCCCTCTACCCGCTGCTGAAAGACCCCTCCCTCAACC  592

Query  545  TGCATATCGTGCACCTGGTCCGGGACCCCCGGGCCGTGTTCCGTTCCCGAGAACGCACAAAGGGAGATCTCATG  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCATATCGTGCACCTGGTCCGGGACCCCCGGGCCGTGTTCCGTTCCCGAGAACGCACAAAGGGAGATCTCATG  666

Query  619  ATTGACAGTCGCATTGTGATGGGGCAGCATGAGCAAAAACTCAAGAAGGAGGACCAACCCTACTATGTGATGCA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGACAGTCGCATTGTGATGGGGCAGCATGAGCAAAAACTCAAGAAGGAGGACCAACCCTACTATGTGATGCA  740

Query  693  GGTCATCTGCCAAAGCCAGCTGGAGATCTACAAGACCATCCAGTCCTTGCCCAAGGCCCTGCAGGAACGCTACC  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCATCTGCCAAAGCCAGCTGGAGATCTACAAGACCATCCAGTCCTTGCCCAAGGCCCTGCAGGAACGCTACC  814

Query  767  TGCTTGTGCGCTATGAGGACCTGGCTCGAGCCCCTGTGGCCCAGACTTCCCGAATGTATGAATTCGTGGGATTG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTTGTGCGCTATGAGGACCTGGCTCGAGCCCCTGTGGCCCAGACTTCCCGAATGTATGAATTCGTGGGATTG  888

Query  841  GAATTCTTGCCCCATCTTCAGACCTGGGTGCATAACATCACCCGAGGCAAGGGCATGGGTGACCACGCTTTCCA  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTCTTGCCCCATCTTCAGACCTGGGTGCATAACATCACCCGAGGCAAGGGCATGGGTGACCACGCTTTCCA  962

Query  915  CACAAATGCCAGGGATGCCCTTAATGTCTCCCAGGCTTGGCGCTGGTCTTTGCCCTATGAAAAGGTTTCTCGAC  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAAATGCCAGGGATGCCCTTAATGTCTCCCAGGCTTGGCGCTGGTCTTTGCCCTATGAAAAGGTTTCTCGAC  1036

Query  989  TTCAGAAAGCCTGTGGCGATGCCATGAATTTGCTGGGCTACCGCCACGTCAGATCTGAACAAGAACAGAGAAAC  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCAGAAAGCCTGTGGCGATGCCATGAATTTGCTGGGCTACCGCCACGTCAGATCTGAACAAGAACAGAGAAAC  1110

Query 1063  CTGTTGCTGGATCTTCTGTCTACCTGGACTGTCCCTGAGCAAATCCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGTTGCTGGATCTTCTGTCTACCTGGACTGTCCCTGAGCAAATCCAC  1158