Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11484
- Subject:
- NM_001144895.2
- Aligned Length:
- 1212
- Identities:
- 842
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
Query 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT 148
Query 149 TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 222
Query 223 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 296
Query 297 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 370
Query 371 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 444
Query 445 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT 518
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTG----------------------------------------------- 471
Query 519 GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGG 592
Sbjct 472 -------------------------------------------------------------------------- 471
Query 593 AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTG 666
Sbjct 472 -------------------------------------------------------------------------- 471
Query 667 AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC 740
Sbjct 472 -------------------------------------------------------------------------- 471
Query 741 TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 814
|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 -------GAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 538
Query 815 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACT 888
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 539 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGT 612
Query 889 GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 613 GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCT 686
Query 963 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct 687 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAG 760
Query 1037 GAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGAC 1110
||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|.
Sbjct 761 GAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAAT 834
Query 1111 GTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA-------------------- 1161
.|||.|||.|.||||||||||||||||.|||||| ||||||.|||.||.|||
Sbjct 835 CTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGC 908
Query 1162 ---------------------------- 1161
Sbjct 909 CCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG 936