Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11484
- Subject:
- NM_001144907.2
- Aligned Length:
- 1180
- Identities:
- 949
- Gaps:
- 203
Alignment
Query 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTG 70
|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.| ||||.| .||.|||.|..
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCA 73
Query 71 GA----TTCCGACAGAC-------TCGAG--GATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGT 131
|| ||||.|.|||| ||.|| |||||| ||||||
Sbjct 74 GACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACA-------------------TGGCCA------------ 116
Query 132 GCTGCAACTCCTCTCC--TTCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAG 203
|||...||||.| ||| ||.|| ||.||||.||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 117 ----CAAGAGCTCTACAGTTC---CTTTT-------CTTCTTGGCCCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAG 176
Query 204 TCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAG 277
|||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 TCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAG 250
Query 278 AGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 251 AGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAA 324
Query 352 TCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAA 425
||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 TCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC---------------------------------------- 358
Query 426 GCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGC 499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 -----------------------------GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGC 403
Query 500 AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAG 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAG 477
Query 574 ATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 ATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTA 551
Query 648 CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAG 721
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTG------------------------------------------- 582
Query 722 AACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGA 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 --------------------------GAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGA 630
Query 796 AACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCA 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCA 704
Query 870 GCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCT 778
Query 944 GGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTC 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTC 852
Query 1018 CAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTG 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 CAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTG 926
Query 1092 GAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 GAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA 996