Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11484
- Subject:
- XR_936147.2
- Aligned Length:
- 1394
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 235
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACCCAGCTTCCTGTTTGTCTTCCTGAGAGACAGTAGATTTAGAAAGTGAGGATCAGAGGGTGGAAAATAAAAGC 74
Query 1 --------------------------------------------ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAG 30
|||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 75 TGTGGTCCCCAGGAGTCCTGAACATCTGGGGACAGCGGGAAAACATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAG 148
Query 31 CAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTGGA----TTCCGACAGAC-------TCGAG- 88
|||||||||||||||||.||.| ||||.| .||.|||.|..|| ||||.|.|||| ||.||
Sbjct 149 CAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGC 221
Query 89 -GAT--------ACAAGAGCT-TAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCAC 152
||| ||||||||| || |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 222 AGATACATGGCCACAAGAGCTCTA-CAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCAT 294
Query 153 GCTCTTGGCTGGG------------CTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAAT 214
||||||||||||| .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 295 GCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAAT 368
Query 215 CCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAG 288
||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 CCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAG 442
Query 289 CTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCA 362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 443 CTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCA 516
Query 363 GGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGA 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 517 GGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGA 590
Query 437 TCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTAC 510
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTAC 664
Query 511 CAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGA 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 CAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGA 738
Query 585 GCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGA 812
Query 659 CCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGAT 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 CCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGAT 886
Query 733 TTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTT 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTT 960
Query 807 CATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAA 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAA 1034
Query 881 TCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTT 1108
Query 955 TCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTG 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 TCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTG 1182
Query 1029 GAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATC 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATC 1256
Query 1103 GATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA--------------- 1161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 GATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAATAGTTGTTTCCCTGC 1330
Query 1162 -------------------------------------------------------------- 1161
Sbjct 1331 TAGCCTCAGCCTCCATTGTGGTATAGCAGAACTTCACCCACTTGCTGGAGTGCAATGGCACG 1392