Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11496
• Subject: NM_001286279.1
• Aligned Length: 1317
• Identities: 1302
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGCGACCCCGGACCAGAAGTCGCCGAACGTTCTGCTGCAGAACCTGTGCTGCAGGATCCTGGGCAGGAGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACCCCGGACCAGAAGTCGCCGAACGTTCTGCTGCAGAACCTGTGCTGCAGGATCCTGGGCAGGAGCGA  74

Query   75  AGCTGATGTAGCCCAGCAGTTCCAGTATGCTGTGCGGGTGATTGGCAGCAACTTCGCCCCAACTGTTGAAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCTGATGTAGCCCAGCAGTTCCAGTATGCTGTGCGGGTGATTGGCAGCAACTTCGCCCCAACTGTTGAAAGAG  148

Query  149  ATGAATTTTTAGTAGCTGAAAAAATCAAGAAAGAGCTTATTCGACAACGAAGAGAAGCAGATGCTGCATTATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAATTTTTAGTAGCTGAAAAAATCAAGAAAGAGCTTATTCGACAACGAAGAGAAGCAGATGCTGCATTATTT  222

Query  223  TCAGAACTCCACAGAAAACTTCATTCACAGGGAGTTTTGAAAAATAAATGGTCAATACTCTACCTCTTGCTGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGAACTCCACAGAAAACTTCATTCACAGGGAGTTTTGAAAAATAAATGGTCAATACTCTACCTCTTGCTGAG  296

Query  297  CCTCAGTGAGGACCCACGCAGGCAGCCAAGCAAGGTTTCTAGCTATGCTACGTTATTTGCTCAGGCCTTACCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCAGTGAGGACCCACGCAGGCAGCCAAGCAAGGTTTCTAGCTATGCTACGTTATTTGCTCAGGCCTTACCAA  370

Query  371  GAGATGCCCACTCAACCCCTTACTACTATGCCAGGCCTCAGACCCTTCCCCTGAGCTACCAAGATCGGAGTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGATGCCCACTCAACCCCTTACTACTATGCCAGGCCTCAGACCCTTCCCCTGAGCTACCAAGATCGGAGTGCC  444

Query  445  CAGTCAGCCCAGAGCTCCGGCAGCGTGGGCAGCAGTGGCATCAGCAGCATTGGCCTGTGTGCCCTCAGTGGCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCAGCCCAGAGCTCCGGCAGCGTGGGCAGCAGTGGCATCAGCAGCATTGGCCTGTGTGCCCTCAGTGGCCC  518

Query  519  CGCGCCTGCGCCACAATCTCTCCTCCCAGGACAGTCTAATCAAGCTCCAGGAGTAGGAGATTGCCTTCGACAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCGCCTGCGCCACAATCTCTCCTCCCAGGACAGTCTAATCAAGCTCCAGGAGTAGGAGATTGCCTTCGACAGC  592

Query  593  AGTTGGGGTCACGACTCGCATGGACTTTAACTGCAAATCAGCCTTCTTCACAAGCCACTACCTCAAAAGGTGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTTGGGGTCACGACTCGCATGGACTTTAACTGCAAATCAGCCTTCTTCACAAGCCACTACCTCAAAAGGTGTC  666

Query  667  CCCAGTGCTGTGTCTCGCAACATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGTGCTGTGTCTCGCAACATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA  740

Query  741  AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG  814

Query  815  AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG  888

Query  889  TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG  962

Query  963  GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAGC  1036

Query 1037  TACAACTAGAGGATGACCAGGGTGTGAATTTGGGACTTGAGAGTAGTTTAACACTTCGGCGCCTCCTGGTTTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TACAACTAGAGGATGACCAGGGTGTGAATTTGGGACTTGAGAGTAGTTTAACACTTCGGCGCCTCCTGGTTTGG  1110

Query 1111  ACCTATGATCCCAAAATACGACTGAAGACCCTTGCGGCCCTAGTGGACCACTGCCAAGGTCCCACGCGCGTCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTATGATCCCAAAATACGACTGAAGACCCTTGCGGCCCTAGTGGACCACTGCCAAGGTCCCACGCGCGTCTT  1184

Query 1185  TCCCACGCACGT---------------CTTTCCCACGCGCGACTTTCCCACGCGCGACTTTCCCATGCACGTCT  1243
            ||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCACGCACGTCTTTCCCACGCGCGACTTTCCCACGCGCGACTTTCCCACGCGCGACTTTCCCATGCACGTCT  1258

Query 1244  TTCCCACGCGCGTCTTTCCCACGCGCGTCTGGCACTCGCTTTGTTTCAGAACTCGTTTG  1302
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCCCACGCGCGTCTTTCCCACGCGCGTCTGGCACTCGCTTTGTTTCAGAACTCGTTTG  1317