Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11501
- Subject:
- XM_006531968.3
- Aligned Length:
- 1578
- Identities:
- 1361
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
|||||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
Query 75 CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA 148
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct 75 CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA 148
Query 149 AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC 222
|||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 149 AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC 222
Query 223 GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
Query 297 CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC 370
.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC 370
Query 371 AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC 444
|.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC 444
Query 445 CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG 518
||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG 518
Query 519 CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG 592
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 519 CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG 592
Query 593 TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG 666
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 593 TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG 666
Query 667 CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT 740
|||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct 667 CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT 740
Query 741 GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA 811
|||| |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 741 GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA 814
Query 812 TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC 885
||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||..
Sbjct 815 TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGGGCGGATGTCTGCTCAGGAGAAT 888
Query 886 ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA 959
..|||..|||||||.||||||.||||||||||..||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 GTACCTGTCATGAATGGCGTCGCAGGCCCGGACAGCGAGGACTACAACCCCTGGGCTGACCGAAAGGCTGCCCA 962
Query 960 GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 1033
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCCAAATCCCTGTCTCCCCCGCAGTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 1036
Query 1034 AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACAGCCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCA 1107
||||||||||.||.||.|||||||||||||||| |.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCA---CTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCA 1107
Query 1108 GCCGGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCT 1181
||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 1108 GCTGGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCT 1181
Query 1182 CCTGAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGA 1255
.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1182 GCTGAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGA 1255
Query 1256 GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGG 1329
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1256 GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGA 1329
Query 1330 CTGCACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCC 1403
.||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1330 TTGCATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCC 1403
Query 1404 ACCCCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACA 1477
.||.||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.|||||||
Sbjct 1404 CCCTCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACA 1477
Query 1478 GTGTGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAGTGGCAGCGGCACG 1551
|.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||||| ||
Sbjct 1478 GCGTGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAG-----------CG 1540
Query 1552 CTGGTGTCCACAGTG--------- 1566
|.|.||||.| ||||
Sbjct 1541 CGGATGTCGA-AGTGGCCAGATTT 1563