Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11546
Subject:
NM_015328.4
Aligned Length:
611
Identities:
461
Gaps:
111

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MSVQVVSAAAAAKVPEVELKDLSPSEAESQLGLSTAAVGAMAPPAGGGDPEAPAPAAERPPVPGPGSGPAAALS  74

Query   1  ----------------------------------MATVTKAP---KKQIQFADDMQEFTKFPTKTGRRSLSRSI  37
                                             ..|||.||   ||||||||..|||.|.|||.|||||||||
Sbjct  75  PAAGKVPQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVKKQIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSI  148

Query  38  SQSSTDSYSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLRKRAQGEK  111
           |||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||||||||
Sbjct 149  SQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEK  222

Query 112  PLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAGVAVFAWKGESEDDFWWCIDRC  185
           ||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||.|||||||||.|..|||||||||||||||||||
Sbjct 223  PLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRC  296

Query 186  VNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDN  259
           ||..|||.|||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  VNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDN  370

Query 260  LYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEV  333
           |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371  LYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEV  444

Query 334  IRQVDVVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRVVLL  407
           |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 445  IRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLL  518

Query 408  AEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPSFDAHLTELTDDQ  481
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 519  AEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQ  592

Query 482  AKYLGLNKNGPFKPNYYRY  500
           |||||||||||||||||||
Sbjct 593  AKYLGLNKNGPFKPNYYRY  611