Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11555
• Subject: NM_006646.6
• Aligned Length: 1554
• Identities: 1432
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGCCTTTAGTGAAGAGGAACATTGAGCCCCGGCACTTGTGCCGGGGAGCTCTGCCTGAAGGGATTACCAGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTTAGTGAAGAGGAACATTGAGCCCCGGCACTTGTGCCGGGGAGCTCTGCCTGAAGGGATTACCAGCGA  74

Query   75  ACTTGAATGTGTAACCAATAGTACTCTTGCCGCTATCATACGCCAGCTGAGCAGTCTGAGCAAACATGCTGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTTGAATGTGTAACCAATAGTACTCTTGCCGCTATCATACGCCAGCTGAGCAGTCTGAGCAAACATGCTGAAG  148

Query  149  ACATATTTGGTGAGTTGTTTAATGAGGCTAACAACTTCTACATCAGAGCAAATTCTCTTCAAGACAGAATTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATATTTGGTGAGTTGTTTAATGAGGCTAACAACTTCTACATCAGAGCAAATTCTCTTCAAGACAGAATTGAT  222

Query  223  CGCCTTGCTGTCAAAGTCACCCAGCTGGATTCAACAGTGGAAGAGGTCTCACTACAGGATATCAACATGAAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTTGCTGTCAAAGTCACCCAGCTGGATTCAACAGTGGAAGAGGTCTCACTACAGGATATCAACATGAAAAA  296

Query  297  AGCTTTCAAAAGTTCCACAGTCCAAGACCAGCAAGTGGTTTCAAAGAACAGCATTCCTAATCCTGTTGCTGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTTTCAAAAGTTCCACAGTCCAAGACCAGCAAGTGGTTTCAAAGAACAGCATTCCTAATCCTGTTGCTGATA  370

Query  371  TTTACAACCAGAGTGATAAGCCACCGCCTCTGAACATCCTGACACCATACAGAGATGACAAGAAGGATGGGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTACAACCAGAGTGATAAGCCACCGCCTCTGAACATCCTGACACCATACAGAGATGACAAGAAGGATGGGCTG  444

Query  445  AAGTTCTATACTGATCCTTCCTATTTCTTTGACCTCTGGAAAGAAAAAATGCTACAGGACACAGAAGACAAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTTCTATACTGATCCTTCCTATTTCTTTGACCTCTGGAAAGAAAAAATGCTACAGGACACAGAAGACAAAAG  518

Query  519  GAAAGAGAAAAGGCGTCAAAAGAGAGAGAAACACAAGC-TGAACCCTAACAGA---AACCAGC----AAGT---  581
            |||||||||||||||||||||| |||     ||.|||| |        |.|||   .||||.|    |.||   
Sbjct  519  GAAAGAGAAAAGGCGTCAAAAG-GAG-----CAAAAGCGT--------ATAGATGGCACCACCCGTGAGGTGAA  578

Query  582  AAATGTGAGAAAAGTCAGAACAAGAAAAG-----AAGAGTGGGAGAGAAGGAAAATG--GGCATTGAGTTTATG  648
            |||.||.|||||||.||||     ||.||     |.||||         ||||.|||  ||||       ||||
Sbjct  579  AAAGGTTAGAAAAGCCAGA-----AACAGGCGCCAGGAGT---------GGAATATGATGGCA-------TATG  631

Query  649  AGTGACGCAAAGA-------------AACTGG-------AGCAG------GCAGGGAGCG----CCAAAGAGGA  692
            |      ||||||             |||.||       || ||      .||.||||||    ||   |||| 
Sbjct  632  A------CAAAGAGCTTAGACCCGACAACAGGTTGTCTCAG-AGTGTGTACCATGGAGCGTCTTCC---GAGG-  694

Query  693  CAGA-----GTGCCCAG----CGGGTCACATGCATCGGACGTTACGGATTACTCTTACCCGGCTACTCCCAACC  757
              ||     ||.|||||    ..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  --GATCCCTGTCCCCAGATACTAGGTCACATGCATCGGACGTTACGGATTACTCTTACCCGGCTACTCCCAACC  766

Query  758  ATTCTCTGCACCCCCAGCCTGTGACCCCTTCCTATGCAGCTGGTGACGTGCCACCACACGGGCCTGCAAGCCAG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  ATTCTCTGCACCCCCAGCCTGTGACCCCTTCCTATGCAGCTGGTGACGTGCCACCACACGGGCCTGCAAGCCAG  840

Query  832  GCTGCGGAGCATGAGTACCGGCCCCCATCTGCCTCGGCGAGGCACATGGCCCTCAACAGACCTCAGCAGCCGCC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  GCTGCGGAGCATGAGTACCGGCCCCCATCTGCCTCGGCGAGGCACATGGCCCTCAACAGACCTCAGCAGCCGCC  914

Query  906  CCCCCCGCCTCCCCCTCAGGCCCCAGAGGGGTCCCAGGCCTCTGCACCGATGGCTCCAGCAGACTACGGGATGC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  CCCCCCGCCTCCCCCTCAGGCCCCAGAGGGGTCCCAGGCCTCTGCACCGATGGCTCCAGCAGACTACGGGATGC  988

Query  980  TCCCAGCGCAGATAATTGAGTATTACAACCCATCCGGACCACCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGATTCCCTCA  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  TCCCAGCGCAGATAATTGAGTATTACAACCCATCCGGACCACCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGATTCCCTCA  1062

Query 1054  GCACAAACTGCCTTCGTCAGCCCTCTCCAGATGCCCATGCAGCCCCCGTTCCCTGCATCAGCCAGCTCCACGCA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  GCACAAACTGCCTTCGTCAGCCCTCTCCAGATGCCCATGCAGCCCCCGTTCCCTGCATCAGCCAGCTCCACGCA  1136

Query 1128  CGCAGCTCCTCCTCACCCACCCTCCACCGGGCTCCTGGTCACAGCCCCGCCACCCCCGGGCCCACCACCTCCCC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  CGCAGCTCCTCCTCACCCACCCTCCACCGGGCTCCTGGTCACAGCCCCGCCACCCCCGGGCCCACCACCTCCCC  1210

Query 1202  CGCCAGGCCCTCCTGGTCCCGGGTCTTCTCTTTCGTCCTCCCCAATGCATGGCCCCCCAGTAGCTGAGGCGAAG  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  CGCCAGGCCCTCCTGGTCCCGGGTCTTCTCTTTCGTCCTCCCCAATGCATGGCCCCCCAGTAGCTGAGGCGAAG  1284

Query 1276  CGGCAAGAGCCTGCACAGCCACCAATCAGTGATGCTCGAAGCGACCTCCTCGCTGCTATTCGAATGGGAATTCA  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  CGGCAAGAGCCTGCACAGCCACCAATCAGTGATGCTCGAAGCGACCTCCTCGCTGCTATTCGAATGGGAATTCA  1358

Query 1350  ACTGAAAAAGGTGCAGGAGCAGCGGGAGCAGGAGGCCAAGCGGGAGCCAGTGGGGAATGACGTGGCCACGATCC  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  ACTGAAAAAGGTGCAGGAGCAGCGGGAGCAGGAGGCCAAGCGGGAGCCAGTGGGGAATGACGTGGCCACGATCC  1432

Query 1424  TGTCCCGGCGCATTGCCGTGGAGTACAGCGACTCTGACGACGACTCAGAGTTCGACGAGAACGACTGGTCCGAC  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  TGTCCCGGCGCATTGCCGTGGAGTACAGCGACTCTGACGACGACTCAGAGTTCGACGAGAACGACTGGTCCGAC  1506