Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11580
• Subject: XM_011524218.2
• Aligned Length: 2316
• Identities: 2154
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ---ATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGT  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGT  74

Query   72  TAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAG  148

Query  146  TAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATATGAAACTAGCCAA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATATGAAACTAGCCAA  222

Query  220  GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAG  296

Query  294  CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGAG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGAG  370

Query  368  TAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACC  444

Query  442  CTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAGGGGAGCTGGCCTCTGCTT  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAGGGGAGCTGGCCTCTGCTT  518

Query  516  CACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCC  592

Query  590  AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC  663
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  593  AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAG---------------------------------------  627

Query  664  AGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG  737
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  628  ------------------------------------------------------GCCAACTGTGATTTGAGACG  647

Query  738  GCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  GCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGA  721

Query  812  AACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  AACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTG  795

Query  886  GGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGCTTTTCAGAATCT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGCTTTTCAGAATCT  869

Query  960  TATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  TATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGA  943

Query 1034  AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAATGGAGCT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAATGGAGCT  1017

Query 1108  GAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGCCTTAGGAGCCCACAGTTTACT  1181
            |||||||||||                                                               
Sbjct 1018  GAAAATGAAAC---------------------------------------------------------------  1028

Query 1182  TAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTAAAAAGGAGG  1255
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  ---GTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTAAAAAGGAGG  1099

Query 1256  AAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACATATCAGGGAACTAAAAAGGATA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  AAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACATATCAGGGAACTAAAAAGGATA  1173

Query 1330  CATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATCTTTTGGG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  CATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATCTTTTGGG  1247

Query 1404  TAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGATACGTAGCTGTGAAAATTCACC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  TAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGATACGTAGCTGTGAAAATTCACC  1321

Query 1478  AGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACCGGATTCAT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  AGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACCGGATTCAT  1395

Query 1552  AAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGATACTGACTCGTTTTGTACAGT  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  AAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGATACTGACTCGTTTTGTACAGT  1469

Query 1626  ATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAAAGAGGCCC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  ATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAAAGAGGCCC  1543

Query 1700  GGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATACACTATGAC  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  GGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATACACTATGAC  1617

Query 1774  CTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTTC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  CTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTTC  1691

Query 1848  GAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACATCACAAGGTGCTGGTACTTATT  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  GAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACATCACAAGGTGCTGGTACTTATT  1765

Query 1922  GGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATGTGTGGTCG  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  GGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATGTGTGGTCG  1839

Query 1996  GTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAACCAGTCTCAGCAAGACATCCT  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  GTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAACCAGTCTCAGCAAGACATCCT  1913

Query 2070  ACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAGTAGTAACACCTGAAGCAAAGG  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  ACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAGTAGTAACACCTGAAGCAAAGG  1987

Query 2144  CGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAGCAGCTGGCCTGTGATCCCTAC  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988  CGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAGCAGCTGGCCTGTGATCCCTAC  2061

Query 2218  TTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTATTGCATCAACCTCTGGGGC  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062  TTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTATTGCATCAACCTCTGGGGC  2135

Query 2292  GTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2313
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  GTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2157