Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- NR_135493.2
- Aligned Length:
- 2770
- Identities:
- 1868
- Gaps:
- 877
Alignment
Query 1 -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC 74
Query 44 TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC 117
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC 148
Query 118 AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG 222
Query 192 AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA 265
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA 296
Query 266 CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG 339
||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG 370
Query 340 GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG 444
Query 414 GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC 518
Query 488 TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC 592
Query 562 CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA 666
Query 636 CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC 740
Query 710 CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA 814
Query 784 CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT 888
Query 858 GAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCG 931
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 889 GAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTG 962
Query 932 ACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG 1005
||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG 1036
Query 1006 GCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG 1079
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG 1110
Query 1080 GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC 1184
Query 1154 CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC 1258
Query 1228 CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC 1332
Query 1302 CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC 1406
Query 1376 TCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCT------------------------ 1425
||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGGGCTGAGACTCTGTCCATCTTCA 1480
Query 1426 ----GACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGC 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCAGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGC 1554
Query 1496 TGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAG 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAG 1628
Query 1570 GACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACA 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACA 1702
Query 1644 CTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGAC 1717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGAC 1776
Query 1718 AGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAG 1850
Query 1792 CTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCC 1865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCC 1924
Query 1866 CAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC---------------------------------------------- 1893
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCACTAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCA 1998
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 1999 GGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCCCAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGA 2072
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2073 CCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGGACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATA 2146
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2147 AAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGAGTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGG 2220
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2221 TGTGGTACTCAGGAGGCTGAGTGGGGAGGATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGC 2294
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2295 TATGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGT 2368
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2369 TTTAAACTGAATGATAATGTAAATATTATACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCC 2442
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2443 GGGCGCGGTGGCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATC 2516
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2517 GAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCG 2590
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2591 AGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGT 2664
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2665 GAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGA 2738
Query 1894 -------------------------------- 1893
Sbjct 2739 AAGAAAAAAAATAAAAAAGAAGCATAACCAGG 2770