Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- NR_135494.2
- Aligned Length:
- 2742
- Identities:
- 1734
- Gaps:
- 988
Alignment
Query 1 -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC 74
Query 44 TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC 117
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC 148
Query 118 AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG 222
Query 192 AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA 265
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA 296
Query 266 CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG 339
||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG 370
Query 340 GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG 444
Query 414 GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC 518
Query 488 TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC 592
Query 562 CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA 635
||||||||
Sbjct 593 CCCAGCCA------------------------------------------------------------------ 600
Query 636 CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 --------------------CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC 654
Query 710 CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA 728
Query 784 CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT 802
Query 858 GAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCG 931
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 803 GAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTG 876
Query 932 ACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG 1005
||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 ACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG 950
Query 1006 GCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG 1079
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 GCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG 1024
Query 1080 GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC 1098
Query 1154 CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC 1172
Query 1228 CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC 1246
Query 1302 CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC 1320
Query 1376 TCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG 1449
||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG 1394
Query 1450 CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT 1523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT 1468
Query 1524 CCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCC 1597
||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1469 CCAGGAAGAAAACCTCT-----------------------------------------------------AGCC 1489
Query 1598 CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT 1563
Query 1672 CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC 1745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564 CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC 1637
Query 1746 TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG 1711
Query 1820 CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1785
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 1786 TAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCAGGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCC 1859
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 1860 CAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGACCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGG 1933
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 1934 ACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATAAAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGA 2007
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2008 GTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGGTGTGGTACTCAGGAGGCTGAGTGGGGAG 2081
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2082 GATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 2155
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2156 TGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGTTTTAAACTGAATGATAATGTAAATATTA 2229
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2230 TACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTATAATCTC 2303
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2304 AGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAAC 2377
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2378 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGAGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAG 2451
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2452 GCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAG 2525
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2526 CCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATAAAAAAGAAGCATAAC 2599
Query 1894 ---- 1893
Sbjct 2600 CAGG 2603