Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- XM_011526362.2
- Aligned Length:
- 2047
- Identities:
- 1381
- Gaps:
- 491
Alignment
Query 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
Query 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC 219
||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.|||| || |.|||.|.|||
Sbjct 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC 219
Query 220 CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG 284
||||||||.|| .|.| ||||||||..|||..|||.|||||| ||||||| |||.|||.|
Sbjct 220 CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG 284
Query 285 ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT 358
||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||
Sbjct 285 ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGA------ 352
Query 359 TCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGT 432
Sbjct 353 -------------------------------------------------------------------------- 352
Query 433 GGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTC 506
Sbjct 353 -------------------------------------------------------------------------- 352
Query 507 ACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGT 580
Sbjct 353 -------------------------------------------------------------------------- 352
Query 581 TCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCC 654
Sbjct 353 -------------------------------------------------------------------------- 352
Query 655 TCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCCTGACC 726
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.|||||| |.|.|| |||||||||
Sbjct 353 -CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCCTGACC 423
Query 727 CTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCG 800
||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.|||||.|
Sbjct 424 CTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGG 497
Query 801 CCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGG 874
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 CTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGG 571
Query 875 GCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCT 947
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 572 GCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCT 644
Query 948 GATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGA 1018
|||.|||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 645 GATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGA 715
Query 1019 ACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCC 1092
||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 716 ACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCC 789
Query 1093 CCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAG 1165
||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 790 CCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAG 862
Query 1166 CCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCC 1239
||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.|.|||
Sbjct 863 CCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCC 936
Query 1240 CTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACACC---- 1307
|.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| |||||||
Sbjct 937 CAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACACCTGCA 1008
Query 1308 -----------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTT 1334
||||||||||||..||||||.||||.|
Sbjct 1009 GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGT 1082
Query 1335 GATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACA 1408
||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.|
Sbjct 1083 GACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGA 1156
Query 1409 GCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAG 1482
||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1157 GCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAG 1218
Query 1483 GACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGA 1556
|||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.||||||||||||||||
Sbjct 1219 GACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGA 1292
Query 1557 CACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGA----CAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACG 1626
|||||||.|..|||||.||||||||.|||| |.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293 CACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCCG-CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACG 1365
Query 1627 TATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCT 1700
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1366 TATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCT 1439
Query 1701 GGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTG--------------------------- 1747
||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1440 GGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAGATGGACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCCCC 1513
Query 1748 ---------------------------------------------------AGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCC 1770
||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1514 AGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCACTCTCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCC 1587
Query 1771 CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA 1661
Query 1845 AGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
|.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1662 AAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 1710